More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1555 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  59.38 
 
 		 204 aa  251  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.91 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  49.46 
 
 		 196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  51.89 
 
 		 199 aa  194  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.91 
 
 		 196 aa  191  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.91 
 
 		 196 aa  191  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.37 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  45.95 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  44.86 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  45.96 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  43.78 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  46.45 
 
 		 196 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  49.17 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  46.45 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  44.32 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  45.95 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  45.11 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  43.85 
 
 		 196 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  43.85 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  43.85 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.85 
 
 		 196 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  43.32 
 
 		 196 aa  177  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  43.85 
 
 		 196 aa  177  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  43.85 
 
 		 196 aa  177  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  43.32 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  43.48 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  43.32 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  43.32 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  43.32 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  42.78 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  42.78 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  43.43 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  42.93 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  40.86 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  46.15 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  45.56 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  45.56 
 
 		 176 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  40.88 
 
 		 175 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  39.41 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.04 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  41.1 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.4 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  40 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  39.16 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  36.9 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  39.62 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  35.29 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  40.79 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3096  transferase hexapeptide protein  43.45 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  37.87 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  42.55 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  40.96 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  44.12 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  41.25 
 
 		 172 aa  118  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  38.78 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1692  hexapaptide repeat-containing transferase  42.95 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3022  hexapaptide repeat-containing transferase  42.33 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  37.72 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  34.91 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  42 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3098  ferripyochelin binding protein  42.33 
 
 		 182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  38.6 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  38.6 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  37.06 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  38.01 
 
 		 174 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0836  carbonic anhydrase  40 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  33.73 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  38.69 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  40 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  36.84 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0585  hexapaptide repeat-containing transferase  36.63 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  37.79 
 
 		 175 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  37.79 
 
 		 175 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  38.01 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3074  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.77 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  37.5 
 
 		 157 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  35.84 
 
 		 192 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2773  hypothetical protein  37.93 
 
 		 172 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000332346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  36.84 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  36.26 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  36.26 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  37.43 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  36.31 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  37.43 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  36.88 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  36.05 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  36.72 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  40.54 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0817  transferase  38.36 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.31 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0246  carbonic anhydrase  37.65 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  38.86 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  40.12 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  36.9 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  38.65 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  37.58 
 
 		 174 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>