More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1554 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  100 
 
 		 402 aa  807    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  63.43 
 
 		 404 aa  549  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.5 
 
 		 401 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.34 
 
 		 406 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.33 
 
 		 406 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.09 
 
 		 400 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.09 
 
 		 400 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.59 
 
 		 401 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.42 
 
 		 406 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.79 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.1 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.85 
 
 		 412 aa  501  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.09 
 
 		 401 aa  500  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.09 
 
 		 401 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.09 
 
 		 401 aa  500  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.09 
 
 		 401 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.34 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.59 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.1 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.6 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.25 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.6 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.1 
 
 		 402 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.35 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.6 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.85 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.1 
 
 		 402 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.1 
 
 		 401 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.1 
 
 		 402 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.2 
 
 		 401 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.1 
 
 		 401 aa  487  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.11 
 
 		 401 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.1 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.35 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.35 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.85 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.85 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.85 
 
 		 402 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.35 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.34 
 
 		 401 aa  478  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.1 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  61.19 
 
 		 402 aa  478  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.5 
 
 		 401 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 401 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.6 
 
 		 400 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3594  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.2 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.6 
 
 		 400 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.85 
 
 		 400 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.09 
 
 		 401 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.35 
 
 		 400 aa  474  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.25 
 
 		 401 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.2 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.1 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5019  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59 
 
 		 400 aa  472  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.582505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.35 
 
 		 401 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.35 
 
 		 400 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.7 
 
 		 401 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.75 
 
 		 403 aa  471  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.25 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.4 
 
 		 404 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.1 
 
 		 401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.85 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.6 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  60.25 
 
 		 402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.6 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00256596  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.6 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.44 
 
 		 402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.35 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  58.75 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.75 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.35 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.35 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000820943  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.16 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3767  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.85 
 
 		 400 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.1 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.35 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.85 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.85 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.35 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.85 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2998  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.85 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.85 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5246  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.85 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.96 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4717  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.85 
 
 		 406 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.85 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.45 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>