More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1540 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 433 aa  855    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.69 
 
 		 424 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.88 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.45 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.14 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.33 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.74 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.21 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.28 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.41 
 
 		 425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.58 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.35 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.45 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.59 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.27 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.98 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.82 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  49.07 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3601  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.7 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 429 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.47 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.59 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.84 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.84 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.59 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  49.07 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.87 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.27 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 591 aa  398  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 422 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.42 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1360  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.49 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.6 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 427 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.6 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.3 
 
 		 421 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.84 
 
 		 429 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  48.96 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.6 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.54 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.34 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.54 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.41 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.4 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.85 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.6 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.33 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.81 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.25 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.91 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0195  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.7 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.14 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.99 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.65 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.02 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.42 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.19 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0528  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>