More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1536 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 556 aa  1085    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  49.44 
 
 		 552 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  39.49 
 
 		 561 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.61 
 
 		 559 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  42.86 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  38.98 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  40 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.34 
 
 		 561 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  41.94 
 
 		 550 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  36.25 
 
 		 561 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.57 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.22 
 
 		 559 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  37.89 
 
 		 560 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.96 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.64 
 
 		 561 aa  358  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  44.67 
 
 		 560 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  36.43 
 
 		 565 aa  356  5e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  37.09 
 
 		 599 aa  355  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  33.21 
 
 		 558 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  43.9 
 
 		 558 aa  353  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  33.81 
 
 		 558 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  37.23 
 
 		 558 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  39.9 
 
 		 581 aa  349  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  36.25 
 
 		 557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  39.83 
 
 		 581 aa  340  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  36.17 
 
 		 563 aa  335  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  34.24 
 
 		 558 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 552 aa  332  8e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  34.25 
 
 		 556 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.78 
 
 		 549 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  35.24 
 
 		 571 aa  330  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  36.02 
 
 		 562 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  38.53 
 
 		 582 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.07 
 
 		 584 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.25 
 
 		 559 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  36.82 
 
 		 559 aa  320  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.83 
 
 		 558 aa  319  7e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  40.12 
 
 		 544 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.32 
 
 		 573 aa  317  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.92 
 
 		 559 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  38.72 
 
 		 582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.15 
 
 		 555 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.33 
 
 		 592 aa  313  6.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.23 
 
 		 559 aa  310  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  32.41 
 
 		 564 aa  309  1.0000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  37.55 
 
 		 565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  37.55 
 
 		 565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  35.52 
 
 		 560 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  34.38 
 
 		 549 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  35.34 
 
 		 568 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  38.27 
 
 		 582 aa  300  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  31.22 
 
 		 537 aa  299  7e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  35.02 
 
 		 547 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  37.62 
 
 		 553 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  31.4 
 
 		 537 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  34.33 
 
 		 549 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  34.92 
 
 		 551 aa  293  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  36.72 
 
 		 591 aa  292  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  34.39 
 
 		 576 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  34.15 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  33.27 
 
 		 547 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  34.68 
 
 		 561 aa  290  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  34.57 
 
 		 578 aa  286  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.12 
 
 		 551 aa  286  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  32.61 
 
 		 549 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  32.8 
 
 		 547 aa  283  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  33.47 
 
 		 585 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  36.13 
 
 		 562 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  37.63 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  33.26 
 
 		 563 aa  278  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  31.74 
 
 		 565 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  35.81 
 
 		 582 aa  276  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  33.02 
 
 		 556 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  35.73 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  33.4 
 
 		 561 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  33.4 
 
 		 584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  35.53 
 
 		 557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  35.41 
 
 		 583 aa  270  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  36.15 
 
 		 566 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  36.33 
 
 		 588 aa  269  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  36.1 
 
 		 544 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  35.6 
 
 		 556 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  27.89 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.65 
 
 		 557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  35.34 
 
 		 542 aa  266  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  35.36 
 
 		 544 aa  267  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  34.06 
 
 		 613 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.61 
 
 		 547 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  35.23 
 
 		 556 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  35.23 
 
 		 543 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  32.25 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  35.05 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.77 
 
 		 527 aa  264  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  30.86 
 
 		 549 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.34 
 
 		 557 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  37.76 
 
 		 546 aa  263  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.02 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.02 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  33.05 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.33 
 
 		 504 aa  261  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>