More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1487 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  100 
 
 
477 aa  959    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  33.87 
 
 
466 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.71 
 
 
470 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.59 
 
 
476 aa  267  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.98 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.55 
 
 
457 aa  254  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.42 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.07 
 
 
473 aa  243  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.27 
 
 
475 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1796  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.64 
 
 
478 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  46.67 
 
 
454 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3578  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  31.75 
 
 
512 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.87 
 
 
463 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  34.22 
 
 
465 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  47.66 
 
 
402 aa  222  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1964  sugar transferase  33.56 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  43.02 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  40.71 
 
 
548 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  42.8 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  43.41 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.42 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  40.85 
 
 
458 aa  213  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  51.53 
 
 
447 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0143  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  31.03 
 
 
499 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.381728  normal  0.0528776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  51.32 
 
 
483 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  39.41 
 
 
460 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  33.94 
 
 
461 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  43.75 
 
 
453 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2476  sugar transferase  40.47 
 
 
366 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0247717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.39 
 
 
426 aa  210  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  35.77 
 
 
467 aa  210  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  50.26 
 
 
460 aa  209  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.08 
 
 
484 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  41.55 
 
 
443 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0948  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  50.54 
 
 
462 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0841997  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  30.96 
 
 
464 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1774  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.81 
 
 
483 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4228  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  29.29 
 
 
493 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00880688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0418  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.33 
 
 
495 aa  207  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0107  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  56.14 
 
 
449 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  50 
 
 
469 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4266  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.32 
 
 
512 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164636  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0046  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  29.27 
 
 
456 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1030  sugar transferase  41.98 
 
 
494 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02218  hypothetical protein  51.76 
 
 
225 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3439  sugar transferase  40.71 
 
 
462 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248565  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  44.44 
 
 
494 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  51.31 
 
 
448 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.11 
 
 
448 aa  203  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  54.26 
 
 
231 aa  203  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0669  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.23 
 
 
448 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000381309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2496  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  50.26 
 
 
464 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  51.3 
 
 
469 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.26 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2049  sugar transferase  38.34 
 
 
467 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.81 
 
 
472 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  39.47 
 
 
329 aa  201  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3194  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  31.93 
 
 
467 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000149665  hitchhiker  0.000297481 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1535  sugar transferase  50 
 
 
469 aa  200  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003543  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  50.75 
 
 
212 aa  199  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  30.75 
 
 
454 aa  199  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2211  sugar transferase  31.43 
 
 
502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645155  normal  0.401902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1979  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.87 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  49.74 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0583  sugar transferase  51.55 
 
 
470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1171  sugar transferase  30.6 
 
 
470 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.01 
 
 
466 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.25 
 
 
346 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2766  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  32.58 
 
 
470 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00178659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.88 
 
 
346 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  31.35 
 
 
468 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  47.4 
 
 
329 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.05 
 
 
471 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  31.32 
 
 
471 aa  192  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  49.21 
 
 
242 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1338  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  32.51 
 
 
553 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4131  sugar transferase  30.7 
 
 
525 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0135201  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  28.8 
 
 
432 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.77 
 
 
464 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  45.83 
 
 
358 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6387  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  32.17 
 
 
522 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3136  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.09 
 
 
306 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.065759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2189  sugar transferase  47.96 
 
 
452 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3794  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  49.74 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  32.81 
 
 
464 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  32.81 
 
 
464 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  30.79 
 
 
445 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  32.81 
 
 
464 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3589  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.79 
 
 
504 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  32.81 
 
 
464 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  32.81 
 
 
464 aa  190  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3584  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33.79 
 
 
504 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356209  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3657  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.79 
 
 
504 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5172  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  30.36 
 
 
502 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00967107  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0013  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35 
 
 
466 aa  189  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.256638  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3524  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  31.12 
 
 
470 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000171122  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3176  sugar transferase  32.41 
 
 
456 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624901  normal  0.0464887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.55 
 
 
464 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0131  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  48.94 
 
 
469 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  32.81 
 
 
464 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>