More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1476 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  100 
 
 
249 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  54.88 
 
 
256 aa  282  4e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  52.24 
 
 
250 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  57.79 
 
 
250 aa  273  1e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  53.66 
 
 
250 aa  273  2e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 
251 aa  273  2e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  58.13 
 
 
250 aa  272  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.34 
 
 
655 aa  270  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 
249 aa  269  3e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  53.88 
 
 
251 aa  269  3e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 
251 aa  268  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.74179e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  55.14 
 
 
254 aa  268  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  51.23 
 
 
248 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  51.23 
 
 
248 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  57.09 
 
 
253 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  55.74 
 
 
250 aa  266  3e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  55.65 
 
 
255 aa  266  3e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  54.32 
 
 
254 aa  265  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  52.67 
 
 
251 aa  264  8e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 
251 aa  264  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 
249 aa  262  5e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 
248 aa  261  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 
253 aa  260  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  2.44559e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 
250 aa  260  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 
252 aa  259  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  6.11161e-06  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.03 
 
 
650 aa  259  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  50 
 
 
253 aa  258  5e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.76682e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  51.43 
 
 
251 aa  256  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 
252 aa  255  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  56.28 
 
 
246 aa  255  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  54.18 
 
 
253 aa  254  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  52.72 
 
 
243 aa  254  1e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  50.82 
 
 
250 aa  254  1e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  53.28 
 
 
251 aa  253  2e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 
250 aa  253  2e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  55.87 
 
 
253 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  55.87 
 
 
253 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 
250 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  50.61 
 
 
251 aa  252  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 
251 aa  252  4e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  2.15074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 
253 aa  251  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  48.16 
 
 
249 aa  251  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  49.19 
 
 
250 aa  251  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 
253 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  51.46 
 
 
243 aa  249  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  52.05 
 
 
257 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  53.04 
 
 
250 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 
252 aa  248  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.54673e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 
251 aa  248  5e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 
254 aa  248  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 
257 aa  247  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  53.04 
 
 
256 aa  247  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  8.20066e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  52.85 
 
 
253 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  50.82 
 
 
254 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 
251 aa  245  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 
251 aa  244  7e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.60979e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 
253 aa  244  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
261 aa  244  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  56.1 
 
 
248 aa  243  2e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  53.44 
 
 
249 aa  243  2e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  49.18 
 
 
251 aa  243  2e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 
254 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.78 
 
 
646 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  46.31 
 
 
250 aa  242  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  48 
 
 
257 aa  242  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  52.07 
 
 
245 aa  242  4e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
255 aa  240  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.07 
 
 
654 aa  239  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  49.57 
 
 
243 aa  239  3e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.47069e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
257 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 
251 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 
256 aa  238  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 
252 aa  238  9e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  48.78 
 
 
249 aa  238  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 
251 aa  237  1e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  50 
 
 
250 aa  237  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 
253 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  52.85 
 
 
255 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 
251 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.93066e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  49.18 
 
 
251 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.40949e-14  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 
245 aa  234  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 
256 aa  234  1e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  5.44988e-07 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  47.39 
 
 
240 aa  234  1e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  51.02 
 
 
248 aa  233  2e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
258 aa  233  2e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 
260 aa  233  2e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.37173e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 
260 aa  233  2e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.78614e-07  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  51.02 
 
 
248 aa  233  2e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 
260 aa  233  2e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.92621e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.57421e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  8.76569e-08  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  8.4878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 
260 aa  232  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.64415e-05  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 
251 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  3.71764e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.21721e-05  unclonable  5.28037e-12 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.72651e-05  hitchhiker  5.21404e-05 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  48.98 
 
 
250 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>