More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1306 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 533 aa  1090    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  59.66 
 
 		 531 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  58.96 
 
 		 531 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  60.34 
 
 		 531 aa  647    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  58.32 
 
 		 531 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  59.85 
 
 		 537 aa  632  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  59.2 
 
 		 531 aa  629  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  59.27 
 
 		 531 aa  624  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  58.85 
 
 		 531 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  58.91 
 
 		 531 aa  596  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  58.32 
 
 		 535 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  55.56 
 
 		 532 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  58.06 
 
 		 541 aa  597  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  54.16 
 
 		 528 aa  594  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  58.13 
 
 		 535 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  57.94 
 
 		 535 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  57.14 
 
 		 534 aa  586  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  57.48 
 
 		 531 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  56.64 
 
 		 533 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  55.28 
 
 		 531 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4734  L-aspartate oxidase  54.3 
 
 		 526 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.734093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  57.17 
 
 		 532 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  57.57 
 
 		 535 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  55.43 
 
 		 533 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  55.43 
 
 		 533 aa  568  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  54.48 
 
 		 534 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  56.23 
 
 		 538 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  56.23 
 
 		 538 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  55.6 
 
 		 542 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  56.4 
 
 		 541 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  54.34 
 
 		 538 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  54.12 
 
 		 539 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  54.34 
 
 		 538 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  54.1 
 
 		 534 aa  556  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  56.55 
 
 		 534 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  54.61 
 
 		 579 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  54.21 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  53.7 
 
 		 525 aa  552  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  55.14 
 
 		 529 aa  552  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  54 
 
 		 537 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  53.82 
 
 		 537 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  54.19 
 
 		 537 aa  554  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  53.05 
 
 		 538 aa  555  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  54.15 
 
 		 537 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  54.49 
 
 		 534 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  53.45 
 
 		 536 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  52.15 
 
 		 539 aa  548  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  55.13 
 
 		 532 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  52.99 
 
 		 533 aa  550  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  54.81 
 
 		 533 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  54.56 
 
 		 537 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  54.81 
 
 		 533 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  53.53 
 
 		 538 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  55.19 
 
 		 533 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  53.67 
 
 		 533 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  53.05 
 
 		 537 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  53.23 
 
 		 537 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5132  L-aspartate oxidase  54.44 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  53.67 
 
 		 533 aa  547  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  53.23 
 
 		 537 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  53.89 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  53.23 
 
 		 537 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  53.67 
 
 		 545 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  53.42 
 
 		 543 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  53.89 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  53.89 
 
 		 540 aa  544  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  55.47 
 
 		 570 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  52.83 
 
 		 538 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  55.47 
 
 		 535 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  52.71 
 
 		 536 aa  542  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  55.47 
 
 		 570 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  55.47 
 
 		 570 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  55.68 
 
 		 533 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  53.89 
 
 		 540 aa  544  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  55.47 
 
 		 570 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  55.45 
 
 		 536 aa  542  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  53.26 
 
 		 537 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  53.8 
 
 		 540 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  53.89 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  55.47 
 
 		 570 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  55.08 
 
 		 529 aa  543  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  53.58 
 
 		 535 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  55.39 
 
 		 523 aa  545  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  52.22 
 
 		 534 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  53.83 
 
 		 528 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  54.41 
 
 		 528 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  52.22 
 
 		 534 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  54.14 
 
 		 530 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  55.11 
 
 		 533 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  51.4 
 
 		 550 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  55.81 
 
 		 546 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  54.34 
 
 		 532 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  54.34 
 
 		 532 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  53.7 
 
 		 540 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  54.1 
 
 		 537 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  52.13 
 
 		 538 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  52.62 
 
 		 533 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  52.89 
 
 		 536 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  55.28 
 
 		 541 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  52.43 
 
 		 533 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>