More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1304 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  100 
 
 
410 aa  820    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  60.05 
 
 
386 aa  481  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  61.66 
 
 
386 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  58.49 
 
 
387 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  56.05 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  54.24 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  56.89 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  56.84 
 
 
404 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  57.44 
 
 
388 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  54.17 
 
 
390 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  54.12 
 
 
405 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  55.13 
 
 
393 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  51.64 
 
 
397 aa  431  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  52.52 
 
 
387 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  50.76 
 
 
407 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  48.72 
 
 
388 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  51.8 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  52.08 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  52.19 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  49.74 
 
 
391 aa  413  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  53.73 
 
 
390 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  49.48 
 
 
387 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  48.76 
 
 
393 aa  408  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 
392 aa  411  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  50 
 
 
392 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  54.22 
 
 
401 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  51.56 
 
 
398 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  51.3 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  51.28 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  51.71 
 
 
396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  50.91 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  51.71 
 
 
396 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  51.71 
 
 
396 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  51.71 
 
 
396 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  51.71 
 
 
396 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  51.71 
 
 
396 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  50.77 
 
 
396 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  51.44 
 
 
396 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  51.71 
 
 
396 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  50.92 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  51.31 
 
 
385 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 
385 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  49.23 
 
 
391 aa  390  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  51.55 
 
 
386 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  51.57 
 
 
385 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  49.87 
 
 
387 aa  382  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  49.21 
 
 
383 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  48.59 
 
 
395 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  48.04 
 
 
381 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  49.48 
 
 
381 aa  360  3e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  48.83 
 
 
380 aa  350  3e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  40.05 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  42.31 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  44.08 
 
 
444 aa  300  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  39.43 
 
 
387 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  38.66 
 
 
387 aa  295  8e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  38.66 
 
 
387 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  38.66 
 
 
387 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  41.07 
 
 
394 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  40.99 
 
 
380 aa  293  5e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  39.38 
 
 
382 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  38.4 
 
 
387 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  38.66 
 
 
385 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  38.4 
 
 
387 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  38.07 
 
 
387 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  38.4 
 
 
387 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  43.3 
 
 
379 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  37.89 
 
 
387 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  40.11 
 
 
397 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  38.14 
 
 
387 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  40.11 
 
 
397 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  38.07 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  40.4 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  38.68 
 
 
395 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  38.68 
 
 
395 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  39.13 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
395 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
395 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
395 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
395 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
395 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  37.63 
 
 
380 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  39.85 
 
 
387 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  38.58 
 
 
395 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  40.11 
 
 
391 aa  282  8.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  41.88 
 
 
393 aa  282  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  42.71 
 
 
376 aa  282  9e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  40.26 
 
 
370 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  37.37 
 
 
380 aa  282  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  41.53 
 
 
375 aa  281  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  39.89 
 
 
380 aa  280  3e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  43.09 
 
 
397 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  37.43 
 
 
399 aa  279  7e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  39.58 
 
 
385 aa  279  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  37.82 
 
 
395 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  39.85 
 
 
400 aa  276  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>