More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1301 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 693 aa  1329    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  56.74 
 
 		 668 aa  631  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  39.45 
 
 		 674 aa  439  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.05 
 
 		 697 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 		 666 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.71 
 
 		 663 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  38.75 
 
 		 741 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  37.84 
 
 		 672 aa  405  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  39.94 
 
 		 670 aa  405  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  36.57 
 
 		 664 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  37.61 
 
 		 658 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  37.9 
 
 		 666 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  38.44 
 
 		 666 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  37.71 
 
 		 688 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 		 636 aa  392  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.24 
 
 		 671 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  35.8 
 
 		 656 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  37.37 
 
 		 676 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  34.14 
 
 		 665 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  37.83 
 
 		 665 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  39.91 
 
 		 672 aa  364  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  32.65 
 
 		 682 aa  360  3e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  37.54 
 
 		 666 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 		 664 aa  335  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  37.37 
 
 		 668 aa  335  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  36.33 
 
 		 673 aa  332  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  37.21 
 
 		 668 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  37.21 
 
 		 668 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  37.21 
 
 		 668 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  36.04 
 
 		 762 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  37.06 
 
 		 678 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  37.62 
 
 		 663 aa  325  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.33 
 
 		 669 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  36.18 
 
 		 652 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  40.25 
 
 		 577 aa  323  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  34.35 
 
 		 775 aa  323  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  37.33 
 
 		 669 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.33 
 
 		 669 aa  321  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.33 
 
 		 669 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.33 
 
 		 669 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.33 
 
 		 669 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  35.77 
 
 		 671 aa  320  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  37.38 
 
 		 663 aa  320  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  36.91 
 
 		 670 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  34.85 
 
 		 773 aa  319  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  36.91 
 
 		 670 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  37.12 
 
 		 666 aa  318  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  36.02 
 
 		 665 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  36.02 
 
 		 665 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  35.88 
 
 		 667 aa  317  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  35.52 
 
 		 771 aa  316  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  36.33 
 
 		 667 aa  312  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 		 585 aa  312  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  34.63 
 
 		 652 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 		 659 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  34.06 
 
 		 650 aa  312  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.71 
 
 		 588 aa  311  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  35.59 
 
 		 648 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 		 674 aa  310  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  35.62 
 
 		 660 aa  309  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  35.05 
 
 		 648 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  35.05 
 
 		 648 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  36.56 
 
 		 586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  34.89 
 
 		 648 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  36.09 
 
 		 656 aa  306  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  35.05 
 
 		 648 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 		 657 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 654 aa  304  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  35.2 
 
 		 648 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  35.16 
 
 		 648 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  35.16 
 
 		 648 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  36.55 
 
 		 660 aa  301  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  37.02 
 
 		 584 aa  299  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  34.16 
 
 		 649 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  33.85 
 
 		 650 aa  298  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  34.9 
 
 		 648 aa  296  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  36.73 
 
 		 659 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  34.12 
 
 		 649 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  35.2 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  34.76 
 
 		 649 aa  294  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  36.14 
 
 		 567 aa  293  8e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  35.15 
 
 		 667 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  33.79 
 
 		 649 aa  291  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.2 
 
 		 655 aa  289  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  36.48 
 
 		 661 aa  289  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  31.33 
 
 		 662 aa  289  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  36.57 
 
 		 659 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  34.58 
 
 		 584 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  37.18 
 
 		 655 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  34.08 
 
 		 662 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 		 584 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  38.7 
 
 		 457 aa  287  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.43 
 
 		 567 aa  286  8e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  35.61 
 
 		 567 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  36.11 
 
 		 659 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.19 
 
 		 680 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  33.39 
 
 		 583 aa  283  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  33.93 
 
 		 674 aa  282  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  35.1 
 
 		 661 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  36.67 
 
 		 661 aa  281  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>