More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1263 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  100 
 
 		 436 aa  874    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  60.98 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  59.86 
 
 		 432 aa  499  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  42.92 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  45.62 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  45.18 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  47.47 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  40.27 
 
 		 447 aa  344  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  44.24 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  44.22 
 
 		 448 aa  338  9e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  43.85 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  44.24 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  42.2 
 
 		 435 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  42.03 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  42.19 
 
 		 435 aa  325  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  41.11 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  42.69 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  41.09 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  41.71 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  41.67 
 
 		 425 aa  303  5.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  37.93 
 
 		 466 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  41.63 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  41.39 
 
 		 426 aa  299  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  41.13 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  37.18 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  40.04 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  39.27 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  39.59 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  39.1 
 
 		 471 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  42.11 
 
 		 428 aa  295  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  39.52 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  37.85 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  38.06 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  38.06 
 
 		 469 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  38.06 
 
 		 469 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  38.49 
 
 		 469 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  39.12 
 
 		 426 aa  293  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  38.36 
 
 		 469 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  37.85 
 
 		 469 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  40.67 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  38.58 
 
 		 469 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  38.79 
 
 		 427 aa  289  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  37.63 
 
 		 463 aa  288  9e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  38.28 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  39.95 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  37.85 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  37.55 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  40.67 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  39.22 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  40.77 
 
 		 465 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  40.48 
 
 		 427 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  39.22 
 
 		 463 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  38.69 
 
 		 426 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  39.91 
 
 		 465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  41.25 
 
 		 427 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  37.72 
 
 		 469 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  40.91 
 
 		 427 aa  286  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  40.24 
 
 		 427 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  37.53 
 
 		 434 aa  285  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  40.86 
 
 		 427 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  41.01 
 
 		 427 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  41.01 
 
 		 427 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  40.6 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  36.96 
 
 		 461 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  43.93 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  36.83 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  39.35 
 
 		 470 aa  279  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  39.4 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  40.04 
 
 		 470 aa  279  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  39.58 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  37.88 
 
 		 426 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  42.79 
 
 		 428 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  38.07 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  39.05 
 
 		 467 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  38.86 
 
 		 462 aa  276  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  42.6 
 
 		 471 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  39.09 
 
 		 470 aa  276  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  35.22 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  38.88 
 
 		 470 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  39.64 
 
 		 473 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  40.15 
 
 		 429 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  38.51 
 
 		 470 aa  272  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  36.88 
 
 		 460 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  39.87 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  36.64 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  42.6 
 
 		 471 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  37.35 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  38.39 
 
 		 429 aa  269  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  38.26 
 
 		 465 aa  269  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  39.65 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  38.56 
 
 		 472 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  36.91 
 
 		 471 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  38.39 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  38.39 
 
 		 426 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  38.83 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  38.34 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  36.96 
 
 		 462 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  34.78 
 
 		 463 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  36.32 
 
 		 462 aa  266  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  38.85 
 
 		 428 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>