More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1198 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1198  ferrochelatase  100 
 
 
443 aa  913    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  46.36 
 
 
387 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  44.55 
 
 
387 aa  276  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07661  ferrochelatase  43.11 
 
 
391 aa  269  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0342613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  43.12 
 
 
387 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4517  ferrochelatase  43.64 
 
 
387 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000264771  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  43.33 
 
 
388 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  43.41 
 
 
387 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  43.41 
 
 
387 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  41 
 
 
391 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  42.22 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  42.99 
 
 
387 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05821  ferrochelatase  41.62 
 
 
391 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1857  ferrochelatase  41.62 
 
 
391 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.89761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0173  ferrochelatase  45.54 
 
 
319 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  41.47 
 
 
391 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  41.32 
 
 
391 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05281  ferrochelatase  40.06 
 
 
391 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  40.83 
 
 
391 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  40.48 
 
 
391 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45357  predicted protein  40 
 
 
509 aa  247  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0976017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2715  ferrochelatase  42.59 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2831  predicted protein  41.18 
 
 
366 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00315896  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0019  ferrochelatase  42.94 
 
 
317 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3312  ferrochelatase  42.02 
 
 
317 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00205193  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1503  ferrochelatase  38.01 
 
 
312 aa  224  3e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2930  ferrochelatase  42.22 
 
 
316 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01700  ferrochelatase, putative  36.78 
 
 
413 aa  223  7e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0845  ferrochelatase  38.33 
 
 
335 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0039  ferrochelatase  39.75 
 
 
317 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2972  ferrochelatase  40.65 
 
 
346 aa  216  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0038  ferrochelatase  38.82 
 
 
317 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0641223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2474  ferrochelatase  39.82 
 
 
362 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0132426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5017  ferrochelatase  42.12 
 
 
348 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400702  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3617  ferrochelatase  42.73 
 
 
362 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07752  mitochondrial ferrochelatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07750)  37.02 
 
 
419 aa  206  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.412365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1130  ferrochelatase  40 
 
 
319 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104879  hitchhiker  0.00676039 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0770  ferrochelatase  36.29 
 
 
352 aa  205  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1258  ferrochelatase  40.29 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1186  ferrochelatase  36.5 
 
 
315 aa  181  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0918  ferrochelatase  36.59 
 
 
316 aa  179  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101664  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0790  ferrochelatase  37.8 
 
 
325 aa  178  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1149  Ferrochelatase  37.96 
 
 
320 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1090  ferrochelatase  37.42 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1218  Ferrochelatase  37.96 
 
 
320 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36859  ferrochelatase precursor  33.63 
 
 
354 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0623  ferrochelatase  33.73 
 
 
337 aa  168  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.235291  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0395  ferrochelatase  33.53 
 
 
343 aa  157  3e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1945  ferrochelatase  32.66 
 
 
343 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1670  ferrochelatase  34.15 
 
 
312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0988  ferrochelatase  32 
 
 
312 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  32.85 
 
 
368 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3547  ferrochelatase  30.28 
 
 
305 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  34.22 
 
 
343 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  34.03 
 
 
367 aa  143  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  31.64 
 
 
367 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  32.39 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  31.27 
 
 
360 aa  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  33.14 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  32.39 
 
 
348 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  32.39 
 
 
348 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  31.75 
 
 
359 aa  139  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  34.33 
 
 
367 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  33.03 
 
 
339 aa  139  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2206  ferrochelatase  28.57 
 
 
330 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0613952  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  32.12 
 
 
339 aa  137  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  32.44 
 
 
370 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  31.82 
 
 
347 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  31.78 
 
 
354 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  32.26 
 
 
339 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  33.23 
 
 
355 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  28.49 
 
 
344 aa  136  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  34.38 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  30.6 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  28.93 
 
 
354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  30.48 
 
 
364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  31.67 
 
 
339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  33.72 
 
 
337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  32.65 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  32.16 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0703  ferrochelatase  31.15 
 
 
314 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  31.96 
 
 
339 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2029  ferrochelatase  31.1 
 
 
313 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  31.64 
 
 
340 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2889  ferrochelatase  28.61 
 
 
339 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00549104  normal  0.445564 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  31.58 
 
 
362 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2591  ferrochelatase  30.59 
 
 
320 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  33.23 
 
 
367 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1333  ferrochelatase  30.55 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  32.44 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  32.44 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  32.44 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  32.44 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  28.12 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  31.95 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  32.19 
 
 
345 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  31.49 
 
 
354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  31.25 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  31.43 
 
 
354 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  33.15 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>