38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1186 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
204 aa  384  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  39.02 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 
269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  34.67 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1685  membrane protein  39.69 
 
 
218 aa  112  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  37.62 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  38.83 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  30.67 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  26.03 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  26.37 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  28.88 
 
 
208 aa  55.1  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 
234 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1815  phosphatidate cytidylyltransferase  30.93 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  33.85 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  27.66 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2262  phosphatidate cytidylyltransferase  34.75 
 
 
181 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0072  protein of unknown function DUF205  30 
 
 
410 aa  52  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  31.15 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58284  dolichol kinase  31.03 
 
 
562 aa  48.9  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0456879  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  24.09 
 
 
227 aa  48.9  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  30.17 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  32.11 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  35.42 
 
 
235 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0763  phosphatidate cytidylyltransferase  30.59 
 
 
183 aa  45.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149439  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34441  predicted protein  30.09 
 
 
286 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  31.36 
 
 
237 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  33.33 
 
 
521 aa  42.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05650  dolichol kinase, putative  39.78 
 
 
1011 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979152  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  34.09 
 
 
225 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  34.09 
 
 
225 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  32.26 
 
 
236 aa  41.6  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  34.78 
 
 
1685 aa  41.6  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03177  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13270)  26.11 
 
 
381 aa  41.6  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0441776  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>