More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1170 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 425 aa  829    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  64.15 
 
 		 428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  59.33 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  56.78 
 
 		 434 aa  481  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  54.46 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  54.4 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  48.59 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 429 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 427 aa  269  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  37.17 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 430 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 430 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 430 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 435 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 433 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 433 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  33.1 
 
 		 434 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  33.1 
 
 		 434 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 		 430 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  33.1 
 
 		 434 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  33.1 
 
 		 434 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  33.1 
 
 		 434 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 439 aa  256  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 		 454 aa  252  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  33.9 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  33.9 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 427 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  34.51 
 
 		 435 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  37.47 
 
 		 432 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  34.13 
 
 		 433 aa  245  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 453 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  34.75 
 
 		 433 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  33.87 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  33.87 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  33.87 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 468 aa  236  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  33.6 
 
 		 434 aa  236  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  31.57 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  31.33 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  31.57 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  31.57 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  33.87 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  33.57 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  32.53 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  33.42 
 
 		 474 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  31.33 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  31.33 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  31.33 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  31.33 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  31.33 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  33.09 
 
 		 480 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 423 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 449 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 441 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 441 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 445 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 		 429 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 420 aa  222  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  32.83 
 
 		 439 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  33.51 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  31.92 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 442 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  33.08 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  33 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  33.5 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  34.71 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 435 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  30.73 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  32.51 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  32.21 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>