More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1126 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
790 aa  1590  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  26.09 
 
 
803 aa  240  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  30.73 
 
 
790 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 
804 aa  228  5e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.9273e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  26.06 
 
 
803 aa  224  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.98 
 
 
720 aa  213  9e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  26.09 
 
 
753 aa  212  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  27.23 
 
 
736 aa  207  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.93 
 
 
464 aa  202  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.48306e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  24.12 
 
 
795 aa  194  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.17 
 
 
779 aa  193  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  32.36 
 
 
739 aa  191  3e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  26.62 
 
 
819 aa  190  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  32.1 
 
 
739 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  32.1 
 
 
739 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  32.1 
 
 
739 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.36 
 
 
741 aa  187  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  32.98 
 
 
740 aa  186  1e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  35.31 
 
 
496 aa  186  2e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  32.55 
 
 
732 aa  186  2e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.67 
 
 
730 aa  184  5e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  26.51 
 
 
763 aa  184  8e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  31.83 
 
 
741 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  31.83 
 
 
741 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.83 
 
 
741 aa  182  3e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.83 
 
 
741 aa  182  3e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  31.83 
 
 
741 aa  182  3e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 
730 aa  181  3e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  31.07 
 
 
751 aa  182  3e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  31.83 
 
 
741 aa  182  3e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.48 
 
 
806 aa  181  6e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.94 
 
 
743 aa  180  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.8 
 
 
741 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  25.63 
 
 
742 aa  178  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  30.81 
 
 
720 aa  176  1e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  22.7 
 
 
814 aa  174  6e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  24.57 
 
 
786 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23 
 
 
734 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  30.22 
 
 
747 aa  171  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  29.32 
 
 
720 aa  170  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  26.2 
 
 
723 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  29.32 
 
 
720 aa  170  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.75 
 
 
737 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  29.32 
 
 
720 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  29.32 
 
 
720 aa  169  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  29.58 
 
 
720 aa  169  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  29.32 
 
 
720 aa  169  3e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  29.32 
 
 
720 aa  168  3e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  29.32 
 
 
720 aa  168  3e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  30.4 
 
 
746 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  30.4 
 
 
746 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  30.4 
 
 
746 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  29.75 
 
 
727 aa  168  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  26.99 
 
 
746 aa  167  7e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.82 
 
 
733 aa  167  1e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  27.97 
 
 
723 aa  166  2e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.53 
 
 
736 aa  166  2e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.5 
 
 
746 aa  165  2e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  23.91 
 
 
772 aa  165  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.83 
 
 
575 aa  165  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  25.37 
 
 
802 aa  165  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  28.45 
 
 
746 aa  164  5e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  26.56 
 
 
722 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  29.06 
 
 
719 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  29.06 
 
 
719 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  29.06 
 
 
719 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  29.06 
 
 
719 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  30.38 
 
 
749 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  29.06 
 
 
719 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.73 
 
 
726 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.73 
 
 
726 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.73 
 
 
726 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  28.73 
 
 
726 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.73 
 
 
726 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.73 
 
 
726 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  28.73 
 
 
726 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.73 
 
 
726 aa  162  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  27.87 
 
 
759 aa  161  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.81 
 
 
726 aa  160  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  30.39 
 
 
734 aa  160  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  33.42 
 
 
624 aa  160  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  28.11 
 
 
755 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  31.51 
 
 
757 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  28.94 
 
 
716 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  35.58 
 
 
503 aa  159  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  39.19 
 
 
232 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.94984e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  29.95 
 
 
745 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  24.25 
 
 
820 aa  159  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.58 
 
 
454 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.12 
 
 
750 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  29.51 
 
 
726 aa  157  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  30.37 
 
 
747 aa  157  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  30 
 
 
740 aa  157  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  22.94 
 
 
772 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  31.31 
 
 
745 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  31.27 
 
 
740 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  25.72 
 
 
797 aa  156  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  32.75 
 
 
667 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  29.64 
 
 
736 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  28.25 
 
 
766 aa  155  3e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>