160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1111 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  52.75 
 
 
711 aa  781    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  48.2 
 
 
756 aa  660    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  51.38 
 
 
752 aa  692    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  47.84 
 
 
703 aa  710    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  49.2 
 
 
685 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  48.84 
 
 
673 aa  672    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  100 
 
 
699 aa  1435    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  48.99 
 
 
669 aa  644    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  50.36 
 
 
684 aa  696    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  48.27 
 
 
680 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  51.65 
 
 
721 aa  704    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  50.07 
 
 
690 aa  716    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  50.36 
 
 
714 aa  654    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  43.99 
 
 
687 aa  641    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  48.73 
 
 
699 aa  646    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  47.83 
 
 
686 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  53.05 
 
 
686 aa  764    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  50.66 
 
 
691 aa  732    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  46.39 
 
 
723 aa  622  1e-177  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  44.65 
 
 
681 aa  614  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  47.77 
 
 
700 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  45.95 
 
 
711 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  45.6 
 
 
705 aa  598  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  42.55 
 
 
686 aa  594  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  45.96 
 
 
715 aa  586  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  45.13 
 
 
696 aa  587  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  44.59 
 
 
700 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  46.52 
 
 
706 aa  569  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  45.92 
 
 
693 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  45.08 
 
 
660 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  44.41 
 
 
725 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  43.43 
 
 
751 aa  555  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  42.45 
 
 
737 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  41.58 
 
 
712 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  43.56 
 
 
720 aa  544  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  42.68 
 
 
706 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  42.07 
 
 
666 aa  537  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  44.33 
 
 
746 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  44.3 
 
 
750 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  41.79 
 
 
678 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  43.77 
 
 
673 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  43.12 
 
 
665 aa  523  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  39.19 
 
 
675 aa  525  1e-147  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  43.35 
 
 
718 aa  515  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  41.74 
 
 
662 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  42.45 
 
 
700 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  38.59 
 
 
681 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  41.22 
 
 
707 aa  506  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  42.25 
 
 
665 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  42.08 
 
 
694 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  39.86 
 
 
720 aa  499  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1310  protein of unknown function DUF255  45.3 
 
 
615 aa  497  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.92977  normal  0.0463256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  39.97 
 
 
680 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  40.48 
 
 
699 aa  492  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  41.18 
 
 
722 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  41.48 
 
 
658 aa  488  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  43.3 
 
 
718 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  40.34 
 
 
733 aa  484  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  38.1 
 
 
700 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  41.88 
 
 
697 aa  485  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  39.94 
 
 
715 aa  485  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  37.79 
 
 
671 aa  482  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  41.6 
 
 
672 aa  485  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  43.16 
 
 
718 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  41.51 
 
 
676 aa  482  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  40 
 
 
681 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  39.38 
 
 
717 aa  477  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  38.64 
 
 
634 aa  478  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  39.42 
 
 
682 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  40.17 
 
 
687 aa  475  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  40.39 
 
 
669 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  39.36 
 
 
699 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  43.08 
 
 
700 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  41.4 
 
 
669 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  41.69 
 
 
676 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  41.09 
 
 
677 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  38.43 
 
 
676 aa  469  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  40.98 
 
 
652 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  40.46 
 
 
667 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  38.71 
 
 
679 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  40.03 
 
 
682 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  37.99 
 
 
670 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  40.17 
 
 
665 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  41.75 
 
 
641 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  39.78 
 
 
710 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  35.92 
 
 
681 aa  455  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  40.49 
 
 
677 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01057  DUF255 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12370)  39.35 
 
 
774 aa  444  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0181431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  40.03 
 
 
673 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  41.29 
 
 
657 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  37.91 
 
 
744 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  38.91 
 
 
687 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  37.97 
 
 
676 aa  436  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1579  protein of unknown function DUF255  41.36 
 
 
610 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  39.63 
 
 
682 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  38.53 
 
 
680 aa  428  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1926  protein of unknown function DUF255  40.73 
 
 
626 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  38.58 
 
 
673 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  55.32 
 
 
381 aa  422  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  38.81 
 
 
656 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>