67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1094 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1094  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
114 aa  229  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4387  hypothetical protein  59.79 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177424  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1808  protein of unknown function DUF45  58 
 
 
111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1669  metal-dependent hydrolase-like  56.84 
 
 
137 aa  104  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000580277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2686  hypothetical protein  55.91 
 
 
103 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1899  hypothetical protein  49.4 
 
 
92 aa  83.6  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2282  protein of unknown function DUF45  48.19 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.879838  hitchhiker  0.00256901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2219  protein of unknown function DUF45  48.19 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3111  metal-dependent hydrolase  48.05 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1569  hypothetical protein  44.71 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184826  unclonable  0.0000116524 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0228  hypothetical protein  46.84 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1174  hypothetical protein  48.05 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1091  protein of unknown function DUF45  43.37 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00838265  normal  0.159075 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0259  hypothetical protein  45.57 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0312  protein of unknown function DUF45  38.14 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.137336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1155  metal-dependent hydrolase-like  45.78 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439664  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0338  protein of unknown function DUF45  40.74 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.860406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0142  protein of unknown function DUF45  40.48 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596952  normal  0.717523 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0842  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0970  protein of unknown function DUF45  35.71 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473345  normal  0.177309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  35.63 
 
 
232 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  36.14 
 
 
233 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  34.29 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  32.94 
 
 
179 aa  50.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  33.75 
 
 
224 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  30.19 
 
 
259 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  34.15 
 
 
253 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  31.43 
 
 
236 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  35.56 
 
 
243 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  33.75 
 
 
223 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  35.16 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  37.5 
 
 
241 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  34.38 
 
 
225 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  31.33 
 
 
245 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 
241 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  32.93 
 
 
243 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  34.94 
 
 
229 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  26.76 
 
 
232 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  35.21 
 
 
224 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  35.35 
 
 
249 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  31.94 
 
 
258 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  36.76 
 
 
254 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  29.27 
 
 
243 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  32.5 
 
 
244 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  34.33 
 
 
251 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  35.71 
 
 
222 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  21.88 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  28.95 
 
 
226 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  29.73 
 
 
224 aa  42  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  32.39 
 
 
223 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  26.92 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  37.14 
 
 
233 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  34.57 
 
 
222 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1663  hypothetical protein  36.92 
 
 
264 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1735  hypothetical protein  36.92 
 
 
264 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1474  hypothetical protein  26.19 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360877  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  35.44 
 
 
268 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  29.89 
 
 
242 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  25.97 
 
 
221 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  27.47 
 
 
227 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  30.3 
 
 
235 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  30.3 
 
 
235 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  25.97 
 
 
222 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>