36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1082 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1082  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  400  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00041216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0092  hypothetical protein  37.85 
 
 
196 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0566  hypothetical protein  41.71 
 
 
182 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.99705e-06  normal  0.489552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2213  hypothetical protein  40.57 
 
 
205 aa  135  3e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2434  hypothetical protein  38.42 
 
 
195 aa  129  2e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2297  hypothetical protein  38.18 
 
 
171 aa  127  1e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1367  hypothetical protein  40.74 
 
 
179 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0543  hypothetical protein  37.93 
 
 
200 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326293  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1901  hypothetical protein  38.59 
 
 
202 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1511  hypothetical protein  35.59 
 
 
199 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0791  hypothetical protein  33.52 
 
 
222 aa  117  2e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2502  hypothetical protein  37.42 
 
 
169 aa  104  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  4.89476e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2514  hypothetical protein  33.74 
 
 
184 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.719359  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1533  Protein of unknown function DUF2179  35.03 
 
 
195 aa  101  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00263143  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1448  hypothetical protein  33.52 
 
 
208 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.399753  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0526  hypothetical protein  34.55 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1967  hypothetical protein  32.39 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.213308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2001  hypothetical protein  32.39 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1857  hypothetical protein  30.51 
 
 
182 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3154  hypothetical protein  29.94 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00210271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3170  hypothetical protein  29.94 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3064  hypothetical protein  29.94 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3420  hypothetical protein  29.94 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3389  hypothetical protein  29.94 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2065  hypothetical protein  33.55 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.11401e-08  hitchhiker  0.00131952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3394  hypothetical protein  29.94 
 
 
182 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3368  hypothetical protein  29.94 
 
 
182 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3390  hypothetical protein  29.94 
 
 
182 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2136  hypothetical protein  30.51 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3052  hypothetical protein  30.67 
 
 
174 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3093  hypothetical protein  30.95 
 
 
183 aa  85.5  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0081056  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0605  hypothetical protein  30.17 
 
 
190 aa  83.6  2e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.872406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2703  hypothetical protein  34.85 
 
 
301 aa  45.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.35804e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  27.78 
 
 
287 aa  42.4  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  27.71 
 
 
289 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  23.13 
 
 
322 aa  41.6  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>