More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1050 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 276 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  45.32 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  43.44 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  43.03 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  42.7 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  43.33 
 
 		 278 aa  208  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  43.82 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  43.9 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  42.22 
 
 		 279 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  44.77 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 278 aa  204  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  41.64 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 		 278 aa  202  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  40.6 
 
 		 271 aa  201  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  42.96 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  42.26 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  45.16 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3798  tryptophan synthase, alpha subunit  38.55 
 
 		 267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  44.31 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  44.31 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  45.12 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  38.34 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  44.26 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  38.38 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  41.06 
 
 		 268 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  42.44 
 
 		 272 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 272 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  38.38 
 
 		 279 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  42.44 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  41.64 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  44.81 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  36.3 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  38.95 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 269 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 279 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  38.58 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  39.42 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  45.56 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 269 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  40.73 
 
 		 280 aa  191  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 278 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  43.09 
 
 		 269 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  41.26 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  40.89 
 
 		 270 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  41.48 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  41.57 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  41.8 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  45.8 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  40.67 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 272 aa  188  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 272 aa  188  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  45.64 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  41.67 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  40.45 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  42.34 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  38.15 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 279 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  39.93 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  41.95 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  42.54 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  39.21 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  42.7 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  40.75 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>