More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0983 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  100 
 
 
289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  73.14 
 
 
293 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  73.14 
 
 
293 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  68.9 
 
 
281 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  68.55 
 
 
281 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  69.26 
 
 
283 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  63.38 
 
 
285 aa  381  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  62.81 
 
 
291 aa  377  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  63.03 
 
 
286 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  61.43 
 
 
296 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  61.97 
 
 
301 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  60.56 
 
 
297 aa  364  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  64.29 
 
 
306 aa  361  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  61.32 
 
 
307 aa  358  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  58.36 
 
 
288 aa  348  8e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  59.38 
 
 
305 aa  347  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  60.07 
 
 
303 aa  345  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  57.24 
 
 
286 aa  339  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  59.11 
 
 
298 aa  338  8e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  59.11 
 
 
298 aa  338  8e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  59.11 
 
 
298 aa  338  8e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  60.21 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  57.49 
 
 
304 aa  333  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  58.8 
 
 
297 aa  332  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  56.46 
 
 
304 aa  328  7e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 
312 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  56.88 
 
 
279 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  56.27 
 
 
279 aa  322  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  54.84 
 
 
277 aa  322  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  56.94 
 
 
305 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  55.04 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  55.04 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  55.04 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  55.4 
 
 
277 aa  319  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  55.48 
 
 
297 aa  319  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  56.2 
 
 
275 aa  315  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  55.4 
 
 
277 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  55.4 
 
 
277 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  55.4 
 
 
277 aa  313  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  55.64 
 
 
282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  57.25 
 
 
279 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  55.56 
 
 
279 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  55 
 
 
280 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  52.48 
 
 
281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  54.38 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  55.64 
 
 
301 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  58.33 
 
 
279 aa  305  7e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  53.9 
 
 
281 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  53.24 
 
 
275 aa  301  6.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  53.99 
 
 
279 aa  301  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  51.97 
 
 
283 aa  301  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  53.76 
 
 
279 aa  300  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  51.58 
 
 
287 aa  299  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  53.68 
 
 
285 aa  299  4e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  53.24 
 
 
281 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  49.83 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  52.86 
 
 
282 aa  285  4e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  50.18 
 
 
277 aa  281  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
277 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  47.06 
 
 
297 aa  279  5e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  49.32 
 
 
295 aa  276  3e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  48.28 
 
 
289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  47.5 
 
 
297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  46.21 
 
 
297 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  48.81 
 
 
293 aa  268  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  49.27 
 
 
321 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  48.01 
 
 
308 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  45.86 
 
 
296 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  48.54 
 
 
355 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  47.45 
 
 
340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  42.56 
 
 
290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 
366 aa  223  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  40.88 
 
 
273 aa  216  4e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  39.72 
 
 
277 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  40.36 
 
 
267 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  35.21 
 
 
282 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 
291 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  37.04 
 
 
290 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  36.43 
 
 
286 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  34.53 
 
 
276 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  36.55 
 
 
273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  31.65 
 
 
258 aa  140  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  32.63 
 
 
270 aa  139  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.04 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.06 
 
 
287 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.36 
 
 
283 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  34.04 
 
 
284 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.21 
 
 
291 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 
271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  34.55 
 
 
271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.27 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  30.66 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  29.39 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  31.29 
 
 
288 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  32.27 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  29.37 
 
 
314 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>