More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0918 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  100 
 
 
453 aa  897  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  36.06 
 
 
455 aa  312  6e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  35.87 
 
 
449 aa  308  2e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  39.51 
 
 
453 aa  304  2e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  39.59 
 
 
448 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  38.39 
 
 
453 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  39.14 
 
 
448 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  39.95 
 
 
446 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  37.53 
 
 
448 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.93735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  39.81 
 
 
447 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  38.03 
 
 
452 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  35.2 
 
 
444 aa  280  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  38.03 
 
 
452 aa  280  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  36.18 
 
 
452 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  36.7 
 
 
451 aa  276  8e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  38.17 
 
 
445 aa  275  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  37.58 
 
 
444 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  37.08 
 
 
449 aa  271  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  39.56 
 
 
452 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  39.38 
 
 
457 aa  270  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  38.22 
 
 
452 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  40.59 
 
 
451 aa  269  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  36.82 
 
 
444 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  36.79 
 
 
444 aa  266  6e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.95 
 
 
429 aa  266  6e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.76 
 
 
449 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  39.91 
 
 
448 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  36.04 
 
 
444 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.12112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  36.88 
 
 
443 aa  263  5e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  32.46 
 
 
462 aa  263  7e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  32.81 
 
 
442 aa  262  7e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  36.59 
 
 
444 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  36.59 
 
 
444 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  36.59 
 
 
444 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  36.59 
 
 
444 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.81 
 
 
442 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  36.45 
 
 
444 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  36.14 
 
 
444 aa  260  5e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  36.22 
 
 
444 aa  259  5e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  36.22 
 
 
444 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  37.14 
 
 
449 aa  255  1e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  37.56 
 
 
451 aa  254  2e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.67 
 
 
442 aa  254  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  35.97 
 
 
447 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  33.77 
 
 
456 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  35.67 
 
 
451 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  37.96 
 
 
443 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  37.19 
 
 
444 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  35.67 
 
 
451 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  36.87 
 
 
446 aa  240  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  37.47 
 
 
464 aa  236  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  34.51 
 
 
468 aa  227  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  39.38 
 
 
451 aa  226  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  29.27 
 
 
430 aa  224  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  30.25 
 
 
440 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  29.73 
 
 
435 aa  216  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.09 
 
 
438 aa  215  1e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98868e-06 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  29.89 
 
 
435 aa  215  2e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  29.89 
 
 
435 aa  215  2e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  31.84 
 
 
436 aa  213  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  39.45 
 
 
435 aa  207  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  31.44 
 
 
437 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  31.65 
 
 
449 aa  206  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  39.45 
 
 
429 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  39.45 
 
 
429 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  34.15 
 
 
432 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  34.26 
 
 
429 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  33.75 
 
 
429 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  29.82 
 
 
430 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  32.38 
 
 
432 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  33.75 
 
 
429 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  34.01 
 
 
429 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  34.91 
 
 
431 aa  199  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  33.75 
 
 
429 aa  199  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  33.5 
 
 
429 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  33.75 
 
 
429 aa  199  9e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  33.5 
 
 
429 aa  199  1e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  33.5 
 
 
429 aa  199  1e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0561  sun protein  33.89 
 
 
412 aa  198  1e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.494153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  33.5 
 
 
429 aa  199  1e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  33.5 
 
 
429 aa  199  1e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  33.5 
 
 
429 aa  199  1e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  33.5 
 
 
429 aa  199  1e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  33.75 
 
 
429 aa  198  2e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  29.2 
 
 
406 aa  197  2e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  37.02 
 
 
450 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  33.48 
 
 
442 aa  197  4e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  33.85 
 
 
439 aa  197  4e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  33.91 
 
 
429 aa  196  8e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  34.31 
 
 
431 aa  196  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  32.85 
 
 
452 aa  195  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  33.66 
 
 
429 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  31.56 
 
 
471 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  35.87 
 
 
429 aa  191  3e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  4.68931e-05 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  32.58 
 
 
433 aa  189  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  32.74 
 
 
431 aa  188  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  32.08 
 
 
431 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.85655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  33.7 
 
 
428 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  26.43 
 
 
428 aa  187  2e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  28.95 
 
 
453 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>