More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0903 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 436 aa  866    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  34.4 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  34.34 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  31.91 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3233  outer membrane efflux protein  33.09 
 
 		 462 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367218  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  31.03 
 
 		 437 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  30.93 
 
 		 455 aa  183  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  29.74 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  25.79 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5135  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0710  Outer membrane protein-like  27.41 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000572058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  27.58 
 
 		 448 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.75 
 
 		 497 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.4 
 
 		 465 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.95 
 
 		 456 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  25.3 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.41 
 
 		 487 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.14 
 
 		 472 aa  87  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  28.82 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.46 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  24.82 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.35 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.75 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.6 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  25.12 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  23.98 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.65 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.17 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.35 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.05 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25.74 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.3 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.91 
 
 		 1470 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.59 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  22.02 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.17 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  24.58 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.24 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.49 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.81 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  25.62 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.62 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  25.62 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.92 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.65 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  25.62 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  25.62 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4920  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.32 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31782  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.62 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  25.65 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5350  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.32 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00199019  normal  0.49097 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3016  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.32 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  25.31 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.02 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.57 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.26 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.14 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.3 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  24.05 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.6 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.77 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1914  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.97 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000272629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  23.15 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  23.15 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  23.15 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  23.15 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  30.32 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5228  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.52 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.68 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.04 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.68 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 1496 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.28 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.27 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  22.97 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.85 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.85 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  24.05 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.22 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.85 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  20.87 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.52 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.52 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  22.27 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.13 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.85 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>