More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0902 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.5 
 
 		 1032 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  43.65 
 
 		 1022 aa  810    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  35.44 
 
 		 1040 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  39.26 
 
 		 1014 aa  691    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  45.69 
 
 		 1048 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.74 
 
 		 1024 aa  899    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  37.25 
 
 		 1044 aa  659    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 		 1046 aa  696    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  38.57 
 
 		 1047 aa  687    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  41.86 
 
 		 1031 aa  796    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.11 
 
 		 1029 aa  713    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  37.43 
 
 		 1043 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  36.8 
 
 		 1026 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.1 
 
 		 1029 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.84 
 
 		 1031 aa  798    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.76 
 
 		 1046 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  41.94 
 
 		 1031 aa  796    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  44.47 
 
 		 1038 aa  781    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  36.9 
 
 		 1015 aa  676    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  37 
 
 		 1015 aa  679    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  41.76 
 
 		 1031 aa  791    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  38.81 
 
 		 1018 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  35.98 
 
 		 1026 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  37.81 
 
 		 1029 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  39.82 
 
 		 1014 aa  687    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.04 
 
 		 1057 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0079  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  37.31 
 
 		 1036 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  39.53 
 
 		 1036 aa  709    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0201  acriflavin resistance protein  37.65 
 
 		 1028 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  39.82 
 
 		 1036 aa  720    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  36.99 
 
 		 1025 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  38.85 
 
 		 1009 aa  695    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  41.81 
 
 		 1041 aa  708    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  36.36 
 
 		 1012 aa  642    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  38.57 
 
 		 1047 aa  687    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  36.61 
 
 		 1036 aa  676    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  37.43 
 
 		 1044 aa  645    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  35.83 
 
 		 1037 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  39.36 
 
 		 1042 aa  692    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  40.21 
 
 		 1028 aa  737    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  42.91 
 
 		 1042 aa  800    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 		 1040 aa  729    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  41.31 
 
 		 1037 aa  745    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  35.99 
 
 		 1029 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1287  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  37.31 
 
 		 1036 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  38.1 
 
 		 1019 aa  683    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  39.2 
 
 		 1017 aa  706    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  41.86 
 
 		 1031 aa  794    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  38.57 
 
 		 1047 aa  687    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  38.29 
 
 		 1019 aa  685    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  54.9 
 
 		 1032 aa  1163    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  37.43 
 
 		 1043 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  40.04 
 
 		 1014 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  40.52 
 
 		 1045 aa  671    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1497  RND HAE1/HME family protein  37.31 
 
 		 1036 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1581  RND HAE1/HME family protein  37.31 
 
 		 1036 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  37.34 
 
 		 1029 aa  646    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4150  acriflavin resistance protein  36.14 
 
 		 1027 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  41.86 
 
 		 1051 aa  763    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  36.36 
 
 		 1012 aa  642    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  41.47 
 
 		 1031 aa  751    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  35.65 
 
 		 1034 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  41.45 
 
 		 1034 aa  795    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  39.53 
 
 		 1014 aa  691    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3139  acriflavin resistance protein  36.62 
 
 		 1012 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389349  normal  0.483157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  42.3 
 
 		 1035 aa  734    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  42.03 
 
 		 1031 aa  791    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  41.94 
 
 		 1046 aa  738    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  43.8 
 
 		 1041 aa  752    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  42.42 
 
 		 1064 aa  784    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  43.47 
 
 		 1036 aa  780    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  38.77 
 
 		 1024 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  41.66 
 
 		 1030 aa  806    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  42.91 
 
 		 1035 aa  800    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  54.6 
 
 		 1026 aa  1137    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  54.32 
 
 		 1030 aa  1134    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0465  acriflavin resistance protein  35.42 
 
 		 1025 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.471269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.63 
 
 		 1068 aa  813    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  39.15 
 
 		 1051 aa  701    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 		 1031 aa  808    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  39.15 
 
 		 1051 aa  698    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 		 1031 aa  808    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  43.25 
 
 		 1036 aa  776    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  41.78 
 
 		 1048 aa  781    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  38.21 
 
 		 1034 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  43.63 
 
 		 1040 aa  765    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  35.55 
 
 		 1034 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09520  RND efflux transporter  36.77 
 
 		 1029 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  38.91 
 
 		 1018 aa  698    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  38.59 
 
 		 1035 aa  697    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  38.47 
 
 		 1037 aa  711    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0528  acriflavin resistance protein  37.02 
 
 		 1026 aa  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  39.01 
 
 		 1035 aa  703    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  43.24 
 
 		 1025 aa  744    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  39.15 
 
 		 1051 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 		 1031 aa  808    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  42.33 
 
 		 1024 aa  754    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.42 
 
 		 1034 aa  770    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  37.7 
 
 		 1033 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  36.54 
 
 		 1028 aa  657    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>