More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0854 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  69.44 
 
 		 183 aa  272  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  68.18 
 
 		 180 aa  261  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  68.57 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  66.86 
 
 		 179 aa  253  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1627  ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  65 
 
 		 196 aa  249  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 180 aa  249  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 181 aa  248  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 189 aa  248  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 182 aa  247  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  64.97 
 
 		 191 aa  247  7e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  247  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  247  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  247  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  247  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  247  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  247  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  247  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 182 aa  246  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  63.79 
 
 		 180 aa  245  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 180 aa  244  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  63.79 
 
 		 181 aa  245  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 189 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 196 aa  244  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 180 aa  244  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 181 aa  244  6.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  63.19 
 
 		 195 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 184 aa  242  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 180 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 180 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 183 aa  242  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 184 aa  242  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 196 aa  241  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0614  ribosomal protein L5  59.57 
 
 		 188 aa  241  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 183 aa  241  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 194 aa  241  6e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  59.46 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 183 aa  240  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 194 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 184 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 187 aa  238  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  63.22 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 193 aa  238  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 192 aa  238  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3983  ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 184 aa  237  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1172  ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0444943  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  62.43 
 
 		 184 aa  237  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  60.92 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 180 aa  237  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 180 aa  237  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 182 aa  235  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 193 aa  235  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  61.58 
 
 		 192 aa  235  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  59.44 
 
 		 184 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  62.64 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  64.37 
 
 		 182 aa  234  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  62.07 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 192 aa  234  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2217  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 195 aa  234  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 220 aa  234  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 184 aa  234  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 180 aa  233  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  62.79 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1173  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00494805  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 188 aa  232  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  61.02 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  59.2 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>