More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0846 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  100 
 
 		 94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  78.16 
 
 		 92 aa  149  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  77.01 
 
 		 92 aa  148  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  146  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  75 
 
 		 89 aa  146  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  75.86 
 
 		 92 aa  143  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 91 aa  142  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  67.74 
 
 		 95 aa  142  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  73.86 
 
 		 88 aa  141  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  70.21 
 
 		 92 aa  141  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  73.33 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  67.03 
 
 		 91 aa  141  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  69.15 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  69.15 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  70.21 
 
 		 94 aa  140  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 98 aa  140  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  67.74 
 
 		 95 aa  140  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  69.15 
 
 		 92 aa  140  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  69.15 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  70.97 
 
 		 97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 98 aa  138  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 		 93 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  77.11 
 
 		 94 aa  138  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 98 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  71.11 
 
 		 90 aa  137  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 93 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 91 aa  136  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  136  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 98 aa  135  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  67.74 
 
 		 93 aa  135  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  76.19 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  76.19 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 98 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  68.6 
 
 		 98 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  68.6 
 
 		 98 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  68.24 
 
 		 94 aa  134  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  68.6 
 
 		 98 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  71.76 
 
 		 94 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  66.67 
 
 		 93 aa  133  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  70.24 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  69.41 
 
 		 94 aa  133  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  64.89 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  67.02 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  67.03 
 
 		 92 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  68.09 
 
 		 93 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 		 92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  65.96 
 
 		 92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  67.02 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  70.24 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  67.03 
 
 		 92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  68.82 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  64.89 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  62.22 
 
 		 90 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  64.89 
 
 		 92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  64.89 
 
 		 92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  67.86 
 
 		 86 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  62.77 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  65.96 
 
 		 93 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  64.89 
 
 		 93 aa  130  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 		 91 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  63.83 
 
 		 93 aa  130  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 		 91 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  62.77 
 
 		 94 aa  130  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 		 94 aa  130  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>