More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0841 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  200  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3163  30S ribosomal protein S10  76 
 
 		 101 aa  164  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.547346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 101 aa  163  8e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0398  30S ribosomal protein S10  76 
 
 		 101 aa  162  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1146  30S ribosomal protein S10  74.75 
 
 		 103 aa  161  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00144145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0598  ribosomal protein S10  74 
 
 		 101 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 101 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5570  ribosomal protein S10  73 
 
 		 101 aa  160  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.966668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1614  ribosomal protein S10  70.71 
 
 		 101 aa  154  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0124  30S ribosomal protein S10  73.74 
 
 		 101 aa  153  9e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_002950  PG1939  30S ribosomal protein S10  71 
 
 		 101 aa  150  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  146  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  68.93 
 
 		 103 aa  146  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  146  8e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2715  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000442606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028025  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  68.69 
 
 		 103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  66.99 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  144  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  144  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  62.75 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1832  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000860395  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  62.75 
 
 		 107 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  65.66 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2278  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000204136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2319  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000523033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0109  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  141  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000877818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  141  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  64 
 
 		 106 aa  140  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  140  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  140  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  140  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2065  30S ribosomal protein S10  68.37 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000262077  normal  0.381336 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0952  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000292109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2424  30S ribosomal protein S10  67 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0052526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0318  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.1858999999999998e-21  hitchhiker  0.0000342143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1852  30S ribosomal protein S10  67.35 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00631354  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  137  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1599  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 106 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0288  30S ribosomal protein S10  67.35 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0179  30S ribosomal protein S10  67.35 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000562136  normal  0.948551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  136  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  137  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  137  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1908  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000309802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  137  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  136  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 		 102 aa  136  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0319  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 106 aa  136  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  136  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1575  ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  136  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000000735097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  135  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>