219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0827 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  100 
 
 		 399 aa  810    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  61.99 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  54.1 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  47.34 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  39.9 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  38.48 
 
 		 438 aa  252  8.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  39.32 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  40.58 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  40.36 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  38.56 
 
 		 419 aa  236  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  41.23 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  36.56 
 
 		 381 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  34.41 
 
 		 439 aa  223  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  37.66 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  37.97 
 
 		 420 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  40.44 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  36.39 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  36.32 
 
 		 602 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  33.92 
 
 		 311 aa  206  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  34.64 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  34.19 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  35.11 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  37.29 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  32.68 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  34.86 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  34.26 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  33.8 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  35.6 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  33.83 
 
 		 431 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  31.77 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  35.73 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  31.91 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  34.06 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  33.52 
 
 		 315 aa  186  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  35.44 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  31.14 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  31.73 
 
 		 315 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  30.6 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  33.09 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  33.51 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  31.22 
 
 		 448 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  31.39 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  30.82 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  31.85 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  31.09 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  31.56 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  33.96 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  29.97 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  32.35 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  34.03 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  32.27 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  30.88 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  34.41 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  32.59 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  30.83 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  31.22 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  30.2 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  30.21 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  28.27 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  28.98 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  30.21 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  29.77 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  30.94 
 
 		 342 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  28.86 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  28.86 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  29.97 
 
 		 357 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  31.02 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  27.86 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  27.15 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  29.77 
 
 		 353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  27.25 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  28.65 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  26.29 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  27.85 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  27.85 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  26.35 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  25.07 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  26.91 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  28.85 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  28.83 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  25.29 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  26.35 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  26.35 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  30.34 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  25.57 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  29.72 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  26.35 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  29.64 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  29.31 
 
 		 359 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  26.06 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  27.56 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  26.06 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  27.44 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  27.44 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  29.25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  27.44 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  26.06 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  26.85 
 
 		 297 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  25.78 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  27.44 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>