More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0747 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  100 
 
 		 511 aa  1025    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  39 
 
 		 502 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  42.86 
 
 		 502 aa  333  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  38.92 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  44.27 
 
 		 499 aa  318  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  41.2 
 
 		 498 aa  315  9e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  40.48 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  40.25 
 
 		 505 aa  310  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.14 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  37.76 
 
 		 473 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.16 
 
 		 513 aa  295  9e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  39.78 
 
 		 511 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  39.54 
 
 		 489 aa  290  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  42.58 
 
 		 498 aa  289  8e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  37.76 
 
 		 483 aa  289  8e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  37.55 
 
 		 483 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  39.8 
 
 		 475 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.99 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  39.91 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  44.5 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  39.11 
 
 		 472 aa  287  4e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  39.07 
 
 		 473 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38.2 
 
 		 474 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  38.2 
 
 		 474 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  39.04 
 
 		 524 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  40.09 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  39.29 
 
 		 525 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  42.03 
 
 		 396 aa  280  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  38.31 
 
 		 464 aa  280  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  37.64 
 
 		 467 aa  279  8e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  39.73 
 
 		 501 aa  279  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  37.5 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.47 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  38.64 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  40.5 
 
 		 506 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  40.95 
 
 		 493 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40.18 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  37.58 
 
 		 471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.91 
 
 		 471 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  39.01 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  37.78 
 
 		 479 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  40.32 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  40.14 
 
 		 462 aa  274  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  37.84 
 
 		 504 aa  274  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  37.89 
 
 		 506 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  40.04 
 
 		 481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  37.5 
 
 		 477 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  37.5 
 
 		 477 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  34.81 
 
 		 545 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  38.6 
 
 		 523 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40 
 
 		 476 aa  272  9e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  37.28 
 
 		 492 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  39.68 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  37.78 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  41.36 
 
 		 489 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40.32 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  36.04 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  39.72 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  38.94 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  39.06 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  37.75 
 
 		 477 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  39.74 
 
 		 473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  39.06 
 
 		 490 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  36.53 
 
 		 483 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  37.78 
 
 		 477 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  39.78 
 
 		 489 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  36.87 
 
 		 490 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  35.25 
 
 		 472 aa  270  7e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  39.29 
 
 		 492 aa  270  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  38.68 
 
 		 514 aa  269  7e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  39.29 
 
 		 492 aa  270  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  40.74 
 
 		 473 aa  270  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  35.75 
 
 		 500 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  39.1 
 
 		 523 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  36.71 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  38.34 
 
 		 487 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  37.94 
 
 		 524 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  39.55 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  37.53 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  38.92 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  36 
 
 		 498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  36.12 
 
 		 485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  36 
 
 		 498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  36 
 
 		 498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  38.46 
 
 		 514 aa  267  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  38.04 
 
 		 481 aa  267  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  38.16 
 
 		 458 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  40.8 
 
 		 515 aa  266  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  35.52 
 
 		 502 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  35.52 
 
 		 502 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  35.52 
 
 		 502 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  35.52 
 
 		 502 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  35.52 
 
 		 502 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  39.73 
 
 		 504 aa  266  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  35.52 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  37.2 
 
 		 477 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  36.55 
 
 		 487 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.86 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  39.21 
 
 		 487 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  37.02 
 
 		 499 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>