More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0746 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  100 
 
 		 161 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  53.66 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  49.7 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  51.85 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  49.69 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  50.61 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  50.91 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  47.85 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.67 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  62.5 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  46.2 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  46.91 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.06 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  45.18 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  42.61 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  54.17 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  47.43 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  46.2 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  50.36 
 
 		 231 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  57.94 
 
 		 200 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  43.18 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  60.36 
 
 		 220 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  58.77 
 
 		 242 aa  145  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  46.84 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  46.06 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  47.56 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  44.32 
 
 		 175 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  56.9 
 
 		 174 aa  143  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  44.94 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  54.17 
 
 		 222 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  46.58 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  56.03 
 
 		 236 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  56.03 
 
 		 238 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  50 
 
 		 234 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  50 
 
 		 234 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  56.64 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  59.26 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  49.65 
 
 		 236 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  46.2 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  60.55 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  60.36 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  50 
 
 		 234 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  58.18 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  59.09 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  42.24 
 
 		 151 aa  141  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  58.49 
 
 		 196 aa  140  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  45.61 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  43.9 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  59.09 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  55.86 
 
 		 222 aa  140  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  58.18 
 
 		 235 aa  140  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  59.63 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  59.46 
 
 		 231 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  58.18 
 
 		 236 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  44.3 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  46.02 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  44.58 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  58.56 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  55.65 
 
 		 192 aa  138  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  45.29 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  46.34 
 
 		 181 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  50.86 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  55.75 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  44.38 
 
 		 175 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  57.89 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  57.89 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  57.89 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  57.89 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  57.89 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  57.89 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  59.05 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  59.05 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  59.05 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  59.05 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  57.89 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  59.05 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  57.89 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  46.32 
 
 		 139 aa  137  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  57.8 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  44.2 
 
 		 188 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  45.18 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  59.8 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  59.8 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  46.72 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  59.8 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  47.92 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  46.32 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  49.61 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  63.11 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  55.08 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  63.11 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  46.29 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  44.3 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  59.43 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  59.43 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  59.43 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>