151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0697 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
203 aa  400  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  41.33 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  49.64 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  45.08 
 
 
196 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  43.81 
 
 
196 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  42 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  35.23 
 
 
193 aa  111  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  35.6 
 
 
193 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  45.45 
 
 
189 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  34.74 
 
 
194 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  33.16 
 
 
195 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  42.98 
 
 
189 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  40.74 
 
 
189 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  36.13 
 
 
195 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  34.67 
 
 
208 aa  99  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  41.32 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  46 
 
 
189 aa  95.9  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  37.57 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  33.51 
 
 
195 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  37.17 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  45 
 
 
189 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  36.84 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  36.25 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  36.84 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  32.99 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  33.85 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  33.52 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  34.03 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  39.81 
 
 
225 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  30.1 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  35.66 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2445  protein of unknown function DUF162  34.88 
 
 
170 aa  61.6  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  30.77 
 
 
183 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  29.51 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  34.62 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  38.3 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  31.13 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  35.79 
 
 
316 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  31.76 
 
 
243 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  39.08 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  34.52 
 
 
219 aa  58.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  35.29 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  34.88 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  36.79 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2668  protein of unknown function DUF162  30.49 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  29.67 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  36.79 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  32 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  32 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  32 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  37.78 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  29.17 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  35.85 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  29.15 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  27.88 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  35.35 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  34.34 
 
 
233 aa  55.5  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  32.81 
 
 
189 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  32.46 
 
 
229 aa  55.1  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  31.86 
 
 
213 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  37.37 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  36.63 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  36.84 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  30 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  34.13 
 
 
241 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  38.78 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  31.91 
 
 
241 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  24.76 
 
 
216 aa  51.2  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  26.58 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  31.91 
 
 
241 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  37 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0361  protein of unknown function DUF162  28.49 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  31.91 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  31.91 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  34.41 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  36.05 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  30.85 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  36.96 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  34.62 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  35.48 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  31.91 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  29.75 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  34.04 
 
 
251 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  36.7 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  35.85 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  32.26 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  25.84 
 
 
215 aa  48.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  33.68 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  37.76 
 
 
236 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>