More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0623 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
638 aa  640    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 
652 aa  698    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 
657 aa  797    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  63.08 
 
 
653 aa  814    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
645 aa  666    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
662 aa  1348    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
645 aa  679    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
640 aa  662    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
647 aa  653    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 
645 aa  680    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  51 
 
 
635 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 
648 aa  769    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
639 aa  641    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
645 aa  680    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
639 aa  635    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
645 aa  680    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
639 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
645 aa  680    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
634 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 
657 aa  788    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
645 aa  680    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
643 aa  658    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
635 aa  654    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  64.49 
 
 
647 aa  856    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 
647 aa  790    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
645 aa  679    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 
677 aa  799    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
657 aa  785    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 
596 aa  661    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
639 aa  641    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
645 aa  680    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 
646 aa  873    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
648 aa  702    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
638 aa  643    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
633 aa  668    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 
637 aa  655    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 
641 aa  889    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
640 aa  665    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
645 aa  677    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
645 aa  679    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
736 aa  682    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 
604 aa  663    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
634 aa  647    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 
648 aa  796    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
659 aa  648    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
649 aa  681    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  66.1 
 
 
647 aa  882    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
639 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 
639 aa  658    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 
657 aa  775    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 
645 aa  883    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  62.21 
 
 
644 aa  851    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 
643 aa  684    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
647 aa  645    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
639 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
635 aa  647    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
659 aa  776    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 
644 aa  716    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
645 aa  679    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
648 aa  660    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 
643 aa  649    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
635 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
675 aa  790    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
637 aa  638    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
645 aa  679    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
636 aa  633  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
638 aa  633  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
636 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
636 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
644 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
636 aa  630  1e-179  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
645 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
639 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
644 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
640 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
645 aa  630  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
640 aa  628  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
639 aa  627  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
640 aa  628  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
646 aa  627  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
608 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
640 aa  619  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
644 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
648 aa  620  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
646 aa  616  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
636 aa  618  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
640 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
635 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 
630 aa  614  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
608 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
645 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
637 aa  603  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 
615 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
604 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
640 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 
610 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
640 aa  598  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
652 aa  595  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
635 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
635 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>