More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0600 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  100 
 
 		 144 aa  286  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  36.79 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0147  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000969846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  40.57 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  37.61 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  36.89 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2512  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  46.15 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  37.14 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  35.09 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  32.08 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  41.94 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  45.56 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  34.15 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  33.09 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  32.39 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  34.86 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0114  30S ribosomal protein S6  33.62 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  37.96 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  36.79 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  36.79 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  36.79 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  33.65 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  27.08 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  35.85 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  39.53 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  35.29 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 168 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  29.55 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3402  ribosomal protein S6  41.12 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301569  normal  0.342869 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  27.97 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  35.71 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  28.47 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  32.12 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_002620  TC0184  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 101 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  30 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  36.26 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  29.91 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>