More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0589 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  100 
 
 		 371 aa  766    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0308  putative response regulator  30.45 
 
 		 506 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.88 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  32.05 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.57 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0183  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  32.92 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.87 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.42 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  26.53 
 
 		 381 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.15 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.55 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 1341 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 378 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.32 
 
 		 602 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.8 
 
 		 1087 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.22 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.54 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  26.49 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.48 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.88 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  29.51 
 
 		 1087 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.08 
 
 		 388 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  41.1 
 
 		 663 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.3 
 
 		 941 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  46.04 
 
 		 1311 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 1131 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  27.72 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.58 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  26.32 
 
 		 568 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.31 
 
 		 470 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  31.12 
 
 		 571 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.39 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 577 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.78 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  42.22 
 
 		 1298 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.6 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.93 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  45.08 
 
 		 234 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  27.56 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 233 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.33 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  37.5 
 
 		 1378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  40.6 
 
 		 1366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  28.45 
 
 		 571 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.84 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.2 
 
 		 684 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  29.8 
 
 		 649 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 1431 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  24.1 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.35 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  26.55 
 
 		 434 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 232 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  27.47 
 
 		 637 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  39.74 
 
 		 1347 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 		 677 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0056  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.58 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2718  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453118  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  24.29 
 
 		 575 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  43.24 
 
 		 1378 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2688  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.92 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  24.73 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2732  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276002  normal  0.519614 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.52 
 
 		 228 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 		 235 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  42.98 
 
 		 228 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  39.78 
 
 		 236 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 223 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  40.44 
 
 		 223 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  26.26 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  27.24 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 231 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 1013 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  28.38 
 
 		 561 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.97 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  28.33 
 
 		 637 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 223 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 806 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 223 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  40.44 
 
 		 223 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.79 
 
 		 407 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 223 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 1002 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 237 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  42.5 
 
 		 230 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 230 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 233 aa  106  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  48.36 
 
 		 243 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 231 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  26.81 
 
 		 557 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 233 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 564 aa  105  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>