224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0546 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  100 
 
 		 579 aa  1180    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  39.41 
 
 		 546 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  41.15 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  37.5 
 
 		 528 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  40.15 
 
 		 533 aa  329  6e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  57.2 
 
 		 334 aa  270  4e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  50.39 
 
 		 341 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  29.21 
 
 		 548 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.67 
 
 		 598 aa  187  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  29.98 
 
 		 567 aa  176  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  27.69 
 
 		 546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  30.05 
 
 		 551 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.19 
 
 		 545 aa  174  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.68 
 
 		 552 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  29.82 
 
 		 550 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.44 
 
 		 556 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.5 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.92 
 
 		 560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  28.94 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  28.12 
 
 		 529 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  27.66 
 
 		 674 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  28.83 
 
 		 552 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  27.37 
 
 		 547 aa  157  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  27.86 
 
 		 563 aa  156  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  28.54 
 
 		 552 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  26.01 
 
 		 555 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  26.4 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  26.2 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  27.04 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  29.54 
 
 		 550 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  27.78 
 
 		 552 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  27.92 
 
 		 558 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  27.2 
 
 		 558 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  28.11 
 
 		 539 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  29.36 
 
 		 549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  27.66 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  27.34 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  27.61 
 
 		 569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  29.09 
 
 		 558 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  29.09 
 
 		 558 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  28.63 
 
 		 553 aa  148  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.18 
 
 		 557 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  26.19 
 
 		 557 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  26.19 
 
 		 557 aa  147  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  26.11 
 
 		 557 aa  146  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  29.27 
 
 		 552 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  29.64 
 
 		 552 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  28.87 
 
 		 549 aa  144  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  27.98 
 
 		 571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  28.29 
 
 		 603 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  26.94 
 
 		 542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  28.82 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  27.02 
 
 		 597 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  30.17 
 
 		 534 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  28.29 
 
 		 558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  28.28 
 
 		 548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  27.48 
 
 		 506 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  24.73 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  27.78 
 
 		 575 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  37.55 
 
 		 491 aa  123  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  25.44 
 
 		 549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  27.24 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  24.91 
 
 		 541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  24.91 
 
 		 541 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  25.13 
 
 		 541 aa  120  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  32.27 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  25.19 
 
 		 540 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  27.5 
 
 		 559 aa  118  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  25.19 
 
 		 532 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  25 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  25 
 
 		 532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  24.82 
 
 		 529 aa  115  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  33.61 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  24.95 
 
 		 540 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  25 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  25 
 
 		 529 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31.88 
 
 		 301 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.9 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  26.29 
 
 		 573 aa  103  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.13 
 
 		 944 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  37.16 
 
 		 325 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  26.33 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  31.85 
 
 		 434 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  26.1 
 
 		 573 aa  100  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  35.11 
 
 		 623 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  30.08 
 
 		 315 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  30.45 
 
 		 318 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  31.36 
 
 		 308 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  29.36 
 
 		 330 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  31.22 
 
 		 394 aa  93.2  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.84 
 
 		 309 aa  93.2  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  25.85 
 
 		 506 aa  92.8  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.58 
 
 		 424 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  30.74 
 
 		 325 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  32.99 
 
 		 322 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  30.58 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  31.58 
 
 		 346 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  28.37 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  31.58 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  27.8 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>