25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0521 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0521  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  332  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1240  hypothetical protein  63.44 
 
 
185 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0131  hypothetical protein  60.22 
 
 
178 aa  204  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1814  hypothetical protein  52.61 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0287  hypothetical protein  56.98 
 
 
150 aa  184  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0885  hypothetical protein  53.07 
 
 
141 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1836  hypothetical protein  51.96 
 
 
134 aa  152  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1547  hypothetical protein  48.6 
 
 
130 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  37.25 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  34.88 
 
 
229 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2067  hypothetical protein  33.65 
 
 
157 aa  57  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000589461  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC60  BdrE  26.14 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000600085  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0132  hypothetical protein  43.82 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0715  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.11482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3254  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  47.8  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000011142  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  29.94 
 
 
694 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  27.78 
 
 
1874 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  33.06 
 
 
380 aa  45.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0670  hypothetical protein  30.36 
 
 
158 aa  45.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217425  decreased coverage  0.0000800314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  34.74 
 
 
1153 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  27.97 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  30.77 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3513  hypothetical protein  32.95 
 
 
113 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000049357 
 
 
-
 
NC_011779  BbuZS7_G34  BdrW  28.16 
 
 
248 aa  42.4  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0500  hypothetical protein  38.16 
 
 
619 aa  42  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.892489  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>