96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0486 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 297 aa  591  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  61.28 
 
 		 294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  61.62 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.78 
 
 		 298 aa  299  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.93 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  59.79 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.4 
 
 		 293 aa  278  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  56.1 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.42 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  37.09 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  34.55 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  37.64 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  36.9 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.19 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  37 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.53 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.82 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.02 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  36 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  36.59 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.99 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.99 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.09 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  35.94 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.27 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  34.91 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.27 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.76 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  35.64 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.91 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.09 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.19 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.18 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  32 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  33.82 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.55 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  35.47 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  33.45 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.18 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  33.45 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  38.77 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  36.21 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  37.82 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  33.21 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.7 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  36.82 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  32.13 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.07 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.1 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  38.43 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  37.5 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  33.45 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  33.22 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  35.29 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  31.02 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  33.46 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.02 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  31.47 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  29.25 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  32.05 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  35.51 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  32.08 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  33.82 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.49 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.21 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.04 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  27.52 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  22.87 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.38 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.38 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.38 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  23.49 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  24.14 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  23.49 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.19 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  23.82 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  22.71 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  38.37 
 
 		 130 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.47 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  25.47 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  25.47 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.87 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  22.26 
 
 		 326 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.03 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.82 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  31.86 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.52 
 
 		 334 aa  45.8  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.76 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.34 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  27.62 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  30.09 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  33.78 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  26.38 
 
 		 1050 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>