31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0462 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1077    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2247  hypothetical protein  27.57 
 
 		 570 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0329  hypothetical protein  37.2 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0179467  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0081  hypothetical protein  33.74 
 
 		 725 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0219  hypothetical protein  26.25 
 
 		 569 aa  108  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2021  hypothetical protein  31.94 
 
 		 380 aa  107  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0664622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3804  hypothetical protein  26.82 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.387517  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2190  hypothetical protein  30.94 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1809  hypothetical protein  30.88 
 
 		 376 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.895599  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0895  hypothetical protein  27.71 
 
 		 491 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.686581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3301  hypothetical protein  30.33 
 
 		 586 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2378  hypothetical protein  33.17 
 
 		 342 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0010  hypothetical protein  28.36 
 
 		 542 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01725  hypothetical protein  31.73 
 
 		 537 aa  89.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0332705  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0509  hypothetical protein  29.91 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1499  hypothetical protein  29.79 
 
 		 271 aa  89.4  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0216  hypothetical protein  29.79 
 
 		 271 aa  89.4  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0663  hypothetical protein  30.14 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3504  hypothetical protein  24.1 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  35.04 
 
 		 665 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 656 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  34.27 
 
 		 2195 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  34.53 
 
 		 665 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.69 
 
 		 1686 aa  50.4  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  30.77 
 
 		 651 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  29.2 
 
 		 368 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.58 
 
 		 2002 aa  47  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1341  hypothetical protein  39.81 
 
 		 967 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.274019  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  31.15 
 
 		 2135 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1627 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  34.34 
 
 		 2191 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>