More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0452 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.39 
 
 		 265 aa  345  6e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.43 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  64 
 
 		 262 aa  342  4e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.6 
 
 		 265 aa  340  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.2 
 
 		 265 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  61.02 
 
 		 265 aa  338  4e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  62.6 
 
 		 265 aa  338  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  61.81 
 
 		 265 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.57 
 
 		 255 aa  332  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  61.26 
 
 		 258 aa  332  6e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.24 
 
 		 265 aa  331  9e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.63 
 
 		 256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  58.43 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.4 
 
 		 253 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.15 
 
 		 253 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.85 
 
 		 262 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.66 
 
 		 300 aa  318  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  60.87 
 
 		 254 aa  318  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.96 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.52 
 
 		 273 aa  315  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.37 
 
 		 257 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  57.87 
 
 		 254 aa  311  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  58.82 
 
 		 257 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  56.47 
 
 		 256 aa  308  6.999999999999999e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.27 
 
 		 255 aa  308  8e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  58.57 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.36 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  55.29 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.57 
 
 		 255 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58 
 
 		 253 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  56.33 
 
 		 249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.2 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.8 
 
 		 257 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  57.6 
 
 		 253 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  57.94 
 
 		 253 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.6 
 
 		 253 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.6 
 
 		 253 aa  296  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.6 
 
 		 253 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  57.6 
 
 		 253 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.8 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.6 
 
 		 253 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.6 
 
 		 253 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.6 
 
 		 253 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.6 
 
 		 253 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  56.63 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.2 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.2 
 
 		 253 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  51.37 
 
 		 255 aa  292  4e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.94 
 
 		 254 aa  292  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  54.07 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.22 
 
 		 259 aa  291  8e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.22 
 
 		 259 aa  291  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  55.65 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  51.17 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.42 
 
 		 314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.18 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.95 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  55.6 
 
 		 253 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  54.51 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.88 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.72 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  54.8 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  52.69 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.22 
 
 		 294 aa  283  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  52.73 
 
 		 265 aa  281  6.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  51.38 
 
 		 268 aa  281  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.97 
 
 		 253 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.22 
 
 		 279 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  52.8 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.97 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.09 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.2 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  54.03 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  56.91 
 
 		 259 aa  279  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.18 
 
 		 262 aa  278  6e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.38 
 
 		 257 aa  278  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.75 
 
 		 262 aa  278  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.6 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  50.97 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.98 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  54.47 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.59 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.96 
 
 		 284 aa  276  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.57 
 
 		 282 aa  275  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  51.78 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.2 
 
 		 261 aa  275  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  50.97 
 
 		 265 aa  275  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.59 
 
 		 262 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  50.97 
 
 		 265 aa  275  8e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  52.8 
 
 		 257 aa  275  8e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  52.8 
 
 		 257 aa  275  8e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.38 
 
 		 257 aa  275  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.1 
 
 		 286 aa  275  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  53.41 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.71 
 
 		 286 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.71 
 
 		 286 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>