More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0418 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  100 
 
 		 600 aa  1209    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  49.83 
 
 		 611 aa  627  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  49.24 
 
 		 614 aa  619  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  50.17 
 
 		 611 aa  615  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  49.16 
 
 		 608 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  48.91 
 
 		 613 aa  608  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  49.83 
 
 		 603 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  48.12 
 
 		 594 aa  594  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  49.08 
 
 		 619 aa  591  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  47.78 
 
 		 586 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  47.75 
 
 		 622 aa  565  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  46.58 
 
 		 591 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  48.82 
 
 		 611 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  47.01 
 
 		 588 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  45.84 
 
 		 588 aa  544  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  45.34 
 
 		 590 aa  540  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  45.01 
 
 		 600 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  48.63 
 
 		 592 aa  541  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  48.58 
 
 		 610 aa  537  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  44.18 
 
 		 587 aa  537  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  45.02 
 
 		 589 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  45.32 
 
 		 607 aa  532  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  44.68 
 
 		 602 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 603 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  43.22 
 
 		 586 aa  528  1e-148  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  43.09 
 
 		 635 aa  523  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  45.79 
 
 		 602 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.25 
 
 		 592 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  43.62 
 
 		 616 aa  515  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  41.67 
 
 		 588 aa  514  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  46.49 
 
 		 650 aa  507  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  44.41 
 
 		 625 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  44.08 
 
 		 623 aa  494  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  43.29 
 
 		 584 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  42.24 
 
 		 587 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  43.63 
 
 		 614 aa  464  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  42.07 
 
 		 587 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  42.07 
 
 		 587 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  45.27 
 
 		 608 aa  459  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  39.86 
 
 		 597 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  41.77 
 
 		 587 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 587 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 587 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.77 
 
 		 587 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.77 
 
 		 587 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.34 
 
 		 587 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.94 
 
 		 587 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  40.24 
 
 		 610 aa  445  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  42.33 
 
 		 617 aa  445  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  39.65 
 
 		 597 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  39.65 
 
 		 597 aa  443  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  42.59 
 
 		 620 aa  443  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  41.75 
 
 		 594 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  40.13 
 
 		 610 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  39.61 
 
 		 610 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  38.78 
 
 		 598 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  38.64 
 
 		 617 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  41.03 
 
 		 602 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  42.01 
 
 		 592 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  41.75 
 
 		 587 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.46 
 
 		 598 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.64 
 
 		 598 aa  432  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.46 
 
 		 598 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 636 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  41.67 
 
 		 621 aa  432  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 598 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.64 
 
 		 598 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  40.26 
 
 		 625 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 592 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 600 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  39.48 
 
 		 608 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  36.58 
 
 		 578 aa  423  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  40.55 
 
 		 609 aa  425  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  40.24 
 
 		 592 aa  425  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  38.11 
 
 		 598 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.11 
 
 		 598 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.29 
 
 		 598 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.11 
 
 		 598 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.11 
 
 		 598 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  38.11 
 
 		 598 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  38.61 
 
 		 622 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.7 
 
 		 637 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  36.53 
 
 		 605 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  39.22 
 
 		 607 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  38.58 
 
 		 594 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  39.24 
 
 		 602 aa  413  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.26 
 
 		 589 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.17 
 
 		 637 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  38.89 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 642 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  35.7 
 
 		 636 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  40.54 
 
 		 598 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  40.72 
 
 		 610 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  40.72 
 
 		 610 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  35.99 
 
 		 599 aa  406  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  38.64 
 
 		 585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3126  ABC transporter related  44.78 
 
 		 592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  40 
 
 		 629 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.69 
 
 		 618 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  35.69 
 
 		 618 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>