50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0405 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0405  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000071012  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  29.73 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.67 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  25.15 
 
 		 269 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  28.34 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  25.3 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  28.06 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.49 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.92 
 
 		 260 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  37.3 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  25.7 
 
 		 365 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 355 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 		 258 aa  45.1  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  23.79 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  32.31 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  27.07 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 		 272 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  29.08 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.25 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  24.59 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  25.5 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.97 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  25.68 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.91 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0047  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.601084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 360 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.07 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.85 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.84 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.1 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  24.84 
 
 		 235 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 273 aa  42  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 376 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  29.13 
 
 		 249 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 416 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 246 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0592  hypothetical protein  26.12 
 
 		 422 aa  41.6  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>