More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0398 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.25 
 
 
747 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  44.22 
 
 
773 aa  635    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  47.18 
 
 
739 aa  639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  47.16 
 
 
735 aa  655    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  46.64 
 
 
743 aa  642    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  43.76 
 
 
789 aa  635    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  49.66 
 
 
735 aa  697    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  43.96 
 
 
757 aa  646    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  46.77 
 
 
741 aa  642    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  100 
 
 
768 aa  1554    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  46.05 
 
 
749 aa  666    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  46.46 
 
 
764 aa  655    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.38 
 
 
741 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  44.34 
 
 
769 aa  646    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  44.14 
 
 
783 aa  635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.89 
 
 
734 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.68 
 
 
732 aa  660    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  49.26 
 
 
743 aa  686    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.93 
 
 
725 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  44.15 
 
 
753 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  46.07 
 
 
755 aa  631  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.85 
 
 
753 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.04 
 
 
751 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.91 
 
 
751 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  44.04 
 
 
751 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.04 
 
 
751 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.91 
 
 
747 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.77 
 
 
729 aa  626  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  51.34 
 
 
715 aa  625  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.67 
 
 
766 aa  627  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.57 
 
 
747 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  49.15 
 
 
756 aa  624  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.68 
 
 
753 aa  625  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.3 
 
 
737 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  45.62 
 
 
739 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  46.45 
 
 
759 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  43.73 
 
 
778 aa  613  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  47.64 
 
 
707 aa  613  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  46.43 
 
 
779 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  44.87 
 
 
744 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  46.79 
 
 
751 aa  609  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.76 
 
 
730 aa  612  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.49 
 
 
755 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.88 
 
 
730 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.88 
 
 
730 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.64 
 
 
711 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.26 
 
 
729 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.85 
 
 
742 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.8 
 
 
757 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  47.47 
 
 
742 aa  599  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.62 
 
 
754 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.54 
 
 
759 aa  596  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.94 
 
 
751 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.2 
 
 
751 aa  598  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.62 
 
 
738 aa  593  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  43.73 
 
 
738 aa  594  1e-168  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  46.94 
 
 
736 aa  588  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  44.27 
 
 
758 aa  584  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  44.36 
 
 
765 aa  584  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  42.78 
 
 
738 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  41.84 
 
 
757 aa  585  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  42.22 
 
 
762 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.13 
 
 
773 aa  582  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.73 
 
 
718 aa  579  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.86 
 
 
748 aa  581  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  45.78 
 
 
737 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.17 
 
 
785 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.68 
 
 
741 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  45.31 
 
 
741 aa  575  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.32 
 
 
694 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  41.96 
 
 
770 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  41.26 
 
 
714 aa  570  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.6 
 
 
829 aa  569  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  44.64 
 
 
746 aa  571  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.84 
 
 
786 aa  568  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.47 
 
 
831 aa  568  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.61 
 
 
1023 aa  566  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.27 
 
 
858 aa  565  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  45.26 
 
 
762 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.8 
 
 
795 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  41.5 
 
 
731 aa  560  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.98 
 
 
837 aa  562  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.26 
 
 
830 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.68 
 
 
758 aa  558  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.34 
 
 
763 aa  556  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.02 
 
 
833 aa  553  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.64 
 
 
851 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.61 
 
 
772 aa  555  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.18 
 
 
781 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  44.93 
 
 
706 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.34 
 
 
794 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  44.88 
 
 
807 aa  551  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  41.71 
 
 
812 aa  550  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.31 
 
 
765 aa  549  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.98 
 
 
785 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  41.63 
 
 
724 aa  546  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.98 
 
 
785 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.92 
 
 
780 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  40.1 
 
 
772 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.63 
 
 
768 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>