More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0379 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  47.54 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  44.63 
 
 
252 aa  239  4e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  43.85 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  43.62 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  43.43 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  42.04 
 
 
253 aa  229  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  44.67 
 
 
257 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  45.65 
 
 
263 aa  225  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  44.08 
 
 
258 aa  224  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  42.45 
 
 
255 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  46.32 
 
 
234 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
296 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  35.08 
 
 
315 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
289 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  30.4 
 
 
271 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
298 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
288 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.94 
 
 
276 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
293 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
289 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 
288 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  30.32 
 
 
289 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
345 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.59 
 
 
278 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.34 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.27 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
302 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  29.43 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.51 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
310 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
340 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
299 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
346 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  33.16 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
311 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
297 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  28.46 
 
 
313 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.12 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
278 aa  86.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
312 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.03 
 
 
370 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
285 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 
312 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  31.55 
 
 
279 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
273 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.41 
 
 
372 aa  85.5  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.64 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  31.4 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.67 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.23 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.64 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.67 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.67 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.08 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.67 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.73 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.08 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.67 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  26.67 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  29.77 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  34.68 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>