More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0355 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 888 aa  1802    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  42.01 
 
 		 897 aa  622  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  36.66 
 
 		 952 aa  531  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  51.94 
 
 		 966 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  49.77 
 
 		 1089 aa  190  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  46.46 
 
 		 935 aa  188  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  48.51 
 
 		 1087 aa  180  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  38.11 
 
 		 1126 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  37.7 
 
 		 1120 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  37.7 
 
 		 1122 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  40.41 
 
 		 1066 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  32.93 
 
 		 1109 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.85 
 
 		 1147 aa  111  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1075 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  35.62 
 
 		 848 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 1123 aa  100  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1075 aa  97.8  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1054 aa  97.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  47.17 
 
 		 957 aa  94.7  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 1114 aa  94.4  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 777 aa  93.2  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 1232 aa  92  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  28.87 
 
 		 1194 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 1123 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 760 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1066 aa  89  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 1105 aa  88.2  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.19 
 
 		 1064 aa  87.4  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 1004 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  25.81 
 
 		 511 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 753 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 828 aa  86.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1052 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  35.75 
 
 		 747 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1257 aa  84.7  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 1001 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 1149 aa  84.3  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1071 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1077 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 845 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  27.5 
 
 		 1041 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1028 aa  82.4  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 1176 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1068 aa  81.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1075 aa  81.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  27.5 
 
 		 1195 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1114 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  26.64 
 
 		 788 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1100 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 992 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 924 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1069 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 798 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1096 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 933 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 836 aa  79  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  26.33 
 
 		 1125 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1010 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1067 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 810 aa  78.2  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 828 aa  78.2  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 1153 aa  77.8  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 790 aa  77.8  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  25.37 
 
 		 1210 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 757 aa  76.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1082 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 1083 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 781 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1007 aa  75.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  24.89 
 
 		 972 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1163 aa  75.1  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  22.4 
 
 		 806 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 812 aa  74.7  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1074 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 757 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 781 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1122 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1105 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1027 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 1038 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  25 
 
 		 1141 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  22.15 
 
 		 831 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 993 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 795 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 918 aa  72  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  25.89 
 
 		 1298 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  25.09 
 
 		 750 aa  72  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1066 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 871 aa  71.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1106 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 999 aa  71.6  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.71 
 
 		 833 aa  71.2  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 991 aa  71.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1023 aa  71.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  23.93 
 
 		 888 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 1188 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  24.69 
 
 		 780 aa  70.5  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1048 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 988 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>