216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0331 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  100 
 
 		 444 aa  878    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  47.34 
 
 		 399 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  41.67 
 
 		 402 aa  273  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  39.84 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  40.05 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  41.18 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  45.7 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  43.16 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  38.98 
 
 		 419 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  42.94 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  41.32 
 
 		 390 aa  236  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  38.56 
 
 		 420 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  41.8 
 
 		 388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  34.89 
 
 		 381 aa  216  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  35.17 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  40.22 
 
 		 363 aa  214  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  37.67 
 
 		 405 aa  213  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  37.5 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  36.9 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  35.69 
 
 		 602 aa  209  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  35.36 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  37.98 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  39.57 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  38.74 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  35.5 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  36.74 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  38.34 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  32.22 
 
 		 439 aa  196  8.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  32.38 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  34.29 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  33.72 
 
 		 312 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  40.38 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  33.25 
 
 		 409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  40.65 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  33.43 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  34.86 
 
 		 307 aa  189  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  37.53 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  33.33 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  30.35 
 
 		 320 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  31.91 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  29.77 
 
 		 320 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  35.1 
 
 		 355 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  28.98 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  35.83 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  35.84 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  34.88 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  33.33 
 
 		 344 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  31.22 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  31.11 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  31.22 
 
 		 472 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  30.98 
 
 		 447 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  31.32 
 
 		 345 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  33.53 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  31.75 
 
 		 423 aa  153  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  30.36 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  30.71 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.88 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  30.37 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  30.03 
 
 		 360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  29.88 
 
 		 448 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  28.5 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  30.47 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  32.11 
 
 		 444 aa  143  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  29.84 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  29.35 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  30.18 
 
 		 352 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  27.74 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  30.28 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  28.95 
 
 		 355 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  26.42 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  29.22 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  28.34 
 
 		 323 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  27.11 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  31.51 
 
 		 342 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  36.89 
 
 		 223 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  29.95 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  31.55 
 
 		 354 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  29.95 
 
 		 355 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  30.26 
 
 		 394 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  27.69 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  29.69 
 
 		 393 aa  127  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  27.46 
 
 		 323 aa  127  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  30.81 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  27.66 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  31.44 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  27.66 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  28.11 
 
 		 325 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  29.24 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  30.42 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  29.1 
 
 		 352 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  32.59 
 
 		 315 aa  123  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  26.71 
 
 		 323 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  30.43 
 
 		 400 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  28.07 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  26.58 
 
 		 323 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  25.37 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  29.47 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  26.57 
 
 		 323 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25.67 
 
 		 323 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  26.57 
 
 		 323 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>