More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0313 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
171 aa  320  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  46.47 
 
 
175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  45.56 
 
 
175 aa  150  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  44.12 
 
 
175 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  44.97 
 
 
175 aa  148  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  42.01 
 
 
175 aa  145  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  40.24 
 
 
175 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  41.42 
 
 
175 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  41.67 
 
 
175 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  38.61 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  43.33 
 
 
164 aa  114  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  38.24 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  38.24 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  38.24 
 
 
179 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  37.74 
 
 
165 aa  100  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  42 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  36.76 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  35.95 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  36 
 
 
194 aa  90.9  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  31.68 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  34.44 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  32.52 
 
 
178 aa  89  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
162 aa  89  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  35.17 
 
 
164 aa  87.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  38.85 
 
 
151 aa  87.8  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  32.7 
 
 
238 aa  87.8  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  32.48 
 
 
164 aa  87.4  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  30.86 
 
 
173 aa  87  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  30.86 
 
 
173 aa  87  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  34.9 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  35.37 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  34.9 
 
 
156 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  32.21 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  34.9 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  29.88 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  39.6 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  38.31 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  34.9 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  34.9 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  34.9 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  38.12 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  30.25 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  35.81 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  30.3 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  31.52 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  28.31 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  30.86 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  32 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  28.67 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.25 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  31.69 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  30.28 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  25.48 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
146 aa  72  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  30.63 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0879  ATP synthase F0, B subunit  32.47 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  33.11 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  36.08 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  36.36 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  29.03 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  29.93 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  37.75 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  32.69 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  30.34 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  30.67 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  29.86 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4190  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000644927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  28.97 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  33.54 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  33.54 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  33.54 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  29.86 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2456  F0F1 ATP synthase subunit B  30.6 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  34.64 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  29.86 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  29.86 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  29.01 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  30.19 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  30.19 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3648  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000138088  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2166  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  31.03 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>