More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0306 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  100 
 
 		 84 aa  165  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  56.63 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  66.6  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  52.63 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000452156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  47.37 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  47.67 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  48.15 
 
 		 86 aa  62  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  44.83 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  45.98 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1648  ribosomal protein S20  48.68 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  45.35 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  40.43 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  46.99 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  43.02 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0211  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000112504  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>