More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0303 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  825    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 424 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  31.27 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  31.55 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  31.18 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  31.18 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  30.33 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  30.66 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  33.42 
 
 		 686 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  29.48 
 
 		 688 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44950  predicted protein  29.29 
 
 		 567 aa  113  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0434742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0111  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 474 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  25.83 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  25.83 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 436 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 710 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.94 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  26.09 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.94 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  25.58 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.94 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  29 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  26.09 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  28.97 
 
 		 730 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.53 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  25.83 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  33.52 
 
 		 686 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.16 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.68 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  31.25 
 
 		 642 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0486  transporter, putative  21.86 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.9 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  25.58 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  27.53 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  25.7 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1478  putative transporter  21.5 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.766379  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0511  transporter, putative  21.61 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  23.32 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.76 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  35.9 
 
 		 431 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 524 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 390 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  28.95 
 
 		 901 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 399 aa  93.2  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  35.06 
 
 		 209 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  33.89 
 
 		 450 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  31.65 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  29.75 
 
 		 709 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 474 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 418 aa  90.5  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1371  hypothetical protein  21.25 
 
 		 402 aa  89.7  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0809978  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.35 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  28.96 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  28.72 
 
 		 688 aa  88.2  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 416 aa  86.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.22 
 
 		 430 aa  86.3  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  29.22 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  28.34 
 
 		 707 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  31.99 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.82 
 
 		 1833 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29.02 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>