112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0289 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 170 aa  337  4e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  48.43 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  49.06 
 
 		 163 aa  168  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  47.2 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  45.96 
 
 		 173 aa  158  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  45.28 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  48.75 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  41.4 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  44.67 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  36.77 
 
 		 178 aa  130  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.65 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  44.03 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.28 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  40.46 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  41.61 
 
 		 151 aa  94.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.74 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.77 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  41.77 
 
 		 173 aa  87.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.47 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  36.42 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 153 aa  84  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  36.91 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  35.1 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  38 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  36.25 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  38.24 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  38.24 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.86 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  34.84 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.56 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  39.57 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  38.81 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  37.09 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  35.25 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  36.03 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  38.17 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.91 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  35.57 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  38.36 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  38.36 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.08 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  31.48 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  35.19 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  35.12 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.54 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  33.95 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  33.74 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.58 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  30.72 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  36.59 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.01 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  31.85 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  36.61 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  51.56 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  38.13 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  38.13 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  38.13 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  30.12 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  30.82 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  37.09 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.66 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  34.03 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.81 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.07 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.07 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  31.51 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  33.52 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  27.87 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.75 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.38 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  27.32 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  29.1 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  32.75 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  30.06 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.88 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.04 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  27.87 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.14 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  31.01 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  26.78 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.59 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  37.06 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  32.68 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  28.4 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  31.71 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.39 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  38.84 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  31.65 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  32.88 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  25.53 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.44 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.69 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.97 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.61 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.03 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>