25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0283 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  689    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  46.85 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  40.65 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  29.77 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  29.89 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  28.28 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  28.88 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1492  hypothetical protein  29.49 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.914795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12378  hypothetical protein  34.87 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0288  hypothetical protein  31.21 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1212  hypothetical protein  28.1 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000090453  decreased coverage  1.89634e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1567  hypothetical protein  34.59 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.338621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  28.82 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  28.63 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  23.71 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2973  hypothetical protein  26.73 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0602  hypothetical protein  26.74 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0852844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  26.18 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  25.37 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10348  hypothetical protein  24.36 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0602  hypothetical protein  24.04 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  27.65 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  25.71 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  25.59 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  25.44 
 
 		 391 aa  46.6  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>