More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0281 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 952 aa  1936    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 888 aa  545  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 897 aa  485  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 966 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  49.33 
 
 		 1089 aa  185  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  47.06 
 
 		 1087 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  45.65 
 
 		 935 aa  174  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  38.43 
 
 		 1147 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  37.77 
 
 		 1066 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1075 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1068 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  31.84 
 
 		 833 aa  102  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1122 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1120 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 988 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  33.75 
 
 		 1126 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 753 aa  95.1  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 1004 aa  94  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 933 aa  93.6  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1027 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 991 aa  91.3  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1109 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.76 
 
 		 848 aa  90.1  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1054 aa  87.8  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  33.76 
 
 		 1084 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 1149 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 747 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 814 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 786 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1020 aa  86.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 777 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1106 aa  86.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1070 aa  85.5  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1010 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 753 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 994 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 1232 aa  85.1  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  32.75 
 
 		 993 aa  85.1  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1036 aa  84.3  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 1063 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 814 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1040 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 982 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  29.96 
 
 		 1041 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 759 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 872 aa  82.8  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1148 aa  82.8  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 933 aa  82.4  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1013 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 924 aa  82  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 989 aa  82  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  46.81 
 
 		 957 aa  82  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1052 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 828 aa  81.6  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  28.71 
 
 		 1080 aa  81.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 836 aa  81.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 992 aa  81.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  34.58 
 
 		 1034 aa  80.9  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1008 aa  80.5  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 1051 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  29.92 
 
 		 800 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 828 aa  80.9  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1007 aa  80.5  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 789 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 831 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 757 aa  79.7  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1075 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  31.02 
 
 		 1195 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1114 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 866 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1028 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 1047 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 1114 aa  79.7  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  31.74 
 
 		 799 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 1001 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1023 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 972 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1062 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  30.04 
 
 		 1043 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 865 aa  79  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  26 
 
 		 1067 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1082 aa  78.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1000 aa  78.2  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1066 aa  78.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 790 aa  78.2  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 760 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1051 aa  78.2  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1124 aa  77.8  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1064 aa  77.8  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1064 aa  77.8  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1173 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1071 aa  77.8  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 791 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 776 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1052 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 919 aa  77.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  31.8 
 
 		 1018 aa  77  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1125 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1081 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>