More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0274 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  48.71 
 
 		 821 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 783 aa  1596    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  50.79 
 
 		 850 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  52.88 
 
 		 826 aa  658    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  50.07 
 
 		 841 aa  632  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  49.93 
 
 		 838 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  48.88 
 
 		 857 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  48.74 
 
 		 870 aa  631  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  50.46 
 
 		 810 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.15 
 
 		 834 aa  625  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  49.49 
 
 		 858 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 801 aa  618  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.81 
 
 		 846 aa  617  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  49.27 
 
 		 862 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  51.4 
 
 		 857 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  48.96 
 
 		 846 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  51.4 
 
 		 857 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  48.95 
 
 		 846 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  49.34 
 
 		 888 aa  598  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  49.09 
 
 		 787 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  48.36 
 
 		 839 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  48.36 
 
 		 844 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  48.36 
 
 		 928 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  46.94 
 
 		 742 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  48.36 
 
 		 844 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  48.36 
 
 		 839 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  48.36 
 
 		 844 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  48.36 
 
 		 844 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  47.83 
 
 		 787 aa  588  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  47.07 
 
 		 743 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  47.07 
 
 		 743 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  46.65 
 
 		 743 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  45.93 
 
 		 732 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  47.44 
 
 		 728 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  47.48 
 
 		 698 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  41.67 
 
 		 774 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  40.45 
 
 		 750 aa  509  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  39.02 
 
 		 743 aa  501  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  41.06 
 
 		 730 aa  497  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  39.11 
 
 		 786 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  41.06 
 
 		 762 aa  489  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  40.92 
 
 		 755 aa  487  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  39.49 
 
 		 760 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  40.71 
 
 		 752 aa  480  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  37.74 
 
 		 762 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  38.81 
 
 		 850 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  39.23 
 
 		 854 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  39.38 
 
 		 765 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  40.23 
 
 		 686 aa  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  37.4 
 
 		 772 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  40.83 
 
 		 675 aa  459  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  37.24 
 
 		 773 aa  458  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  36.35 
 
 		 768 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  41.86 
 
 		 678 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  36.81 
 
 		 767 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  37.62 
 
 		 759 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  37.55 
 
 		 785 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  37.83 
 
 		 740 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  37.52 
 
 		 794 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  36.23 
 
 		 815 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  36.72 
 
 		 786 aa  429  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  36.24 
 
 		 907 aa  415  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  33.2 
 
 		 776 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  32.06 
 
 		 827 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  32.68 
 
 		 819 aa  344  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  31.75 
 
 		 809 aa  344  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  31.82 
 
 		 829 aa  343  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  31.86 
 
 		 823 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  31.86 
 
 		 823 aa  336  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  31.58 
 
 		 777 aa  332  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  33.65 
 
 		 800 aa  332  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  31.78 
 
 		 830 aa  330  7e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  31.97 
 
 		 814 aa  330  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  32.53 
 
 		 796 aa  330  8e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  31.08 
 
 		 817 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 817 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  31.3 
 
 		 841 aa  330  9e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  33.1 
 
 		 779 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  33.1 
 
 		 794 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  31.73 
 
 		 773 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  31.46 
 
 		 817 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  31.69 
 
 		 819 aa  327  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  31.7 
 
 		 814 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  30.79 
 
 		 817 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  31.47 
 
 		 814 aa  324  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  32.46 
 
 		 803 aa  324  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 818 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  32.61 
 
 		 748 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  32.1 
 
 		 795 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  32.02 
 
 		 804 aa  321  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  32.24 
 
 		 771 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  33.01 
 
 		 790 aa  320  6e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  31.18 
 
 		 797 aa  320  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  31.18 
 
 		 815 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  32.44 
 
 		 803 aa  318  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0444  penicillin-binding protein, 1A family  31.6 
 
 		 848 aa  317  7e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0671851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  30.83 
 
 		 814 aa  317  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  32.39 
 
 		 791 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  31.11 
 
 		 818 aa  315  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  29.6 
 
 		 845 aa  314  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>